Protein–RNA interactions for Protein: O95347

SMC2, Structural maintenance of chromosomes protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC2O95347 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SMC2O95347 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SMC2O95347 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SMC2O95347 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SMC2O95347 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SMC2O95347 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SMC2O95347 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SMC2O95347 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SMC2O95347 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SMC2O95347 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SMC2O95347 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
SMC2O95347 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SMC2O95347 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SMC2O95347 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.24
SMC2O95347 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SMC2O95347 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SMC2O95347 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SMC2O95347 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SMC2O95347 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SMC2O95347 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SMC2O95347 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SMC2O95347 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SMC2O95347 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SMC2O95347 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SMC2O95347 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SMC2O95347 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SMC2O95347 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SMC2O95347 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SMC2O95347 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SMC2O95347 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
SMC2O95347 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SMC2O95347 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SMC2O95347 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SMC2O95347 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SMC2O95347 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SMC2O95347 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SMC2O95347 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SMC2O95347 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SMC2O95347 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SMC2O95347 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SMC2O95347 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SMC2O95347 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SMC2O95347 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SMC2O95347 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
SMC2O95347 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SMC2O95347 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SMC2O95347 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SMC2O95347 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SMC2O95347 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SMC2O95347 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SMC2O95347 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SMC2O95347 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SMC2O95347 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SMC2O95347 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SMC2O95347 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SMC2O95347 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SMC2O95347 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SMC2O95347 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SMC2O95347 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SMC2O95347 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SMC2O95347 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SMC2O95347 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMC2O95347 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMC2O95347 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMC2O95347 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMC2O95347 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMC2O95347 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMC2O95347 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMC2O95347 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMC2O95347 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SMC2O95347 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SMC2O95347 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
SMC2O95347 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SMC2O95347 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SMC2O95347 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SMC2O95347 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SMC2O95347 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SMC2O95347 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SMC2O95347 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SMC2O95347 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SMC2O95347 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SMC2O95347 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SMC2O95347 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SMC2O95347 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SMC2O95347 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SMC2O95347 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SMC2O95347 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SMC2O95347 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SMC2O95347 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SMC2O95347 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SMC2O95347 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
SMC2O95347 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SMC2O95347 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SMC2O95347 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SMC2O95347 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SMC2O95347 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SMC2O95347 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SMC2O95347 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SMC2O95347 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SMC2O95347 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms