Protein–RNA interactions for Protein: O95219

SNX4, Sorting nexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX4O95219 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX4O95219 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX4O95219 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX4O95219 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX4O95219 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SNX4O95219 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX4O95219 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX4O95219 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX4O95219 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX4O95219 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX4O95219 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX4O95219 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX4O95219 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX4O95219 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX4O95219 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX4O95219 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX4O95219 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX4O95219 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX4O95219 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX4O95219 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX4O95219 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX4O95219 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX4O95219 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX4O95219 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX4O95219 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX4O95219 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX4O95219 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX4O95219 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX4O95219 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX4O95219 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX4O95219 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX4O95219 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX4O95219 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX4O95219 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX4O95219 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX4O95219 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX4O95219 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX4O95219 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX4O95219 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SNX4O95219 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SNX4O95219 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SNX4O95219 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SNX4O95219 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX4O95219 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX4O95219 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX4O95219 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX4O95219 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX4O95219 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX4O95219 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX4O95219 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX4O95219 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX4O95219 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX4O95219 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX4O95219 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX4O95219 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX4O95219 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX4O95219 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX4O95219 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX4O95219 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX4O95219 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX4O95219 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX4O95219 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX4O95219 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX4O95219 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX4O95219 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX4O95219 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX4O95219 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX4O95219 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX4O95219 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX4O95219 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX4O95219 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX4O95219 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX4O95219 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX4O95219 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX4O95219 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX4O95219 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX4O95219 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX4O95219 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX4O95219 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX4O95219 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SNX4O95219 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX4O95219 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX4O95219 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX4O95219 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX4O95219 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX4O95219 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX4O95219 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX4O95219 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX4O95219 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX4O95219 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX4O95219 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX4O95219 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX4O95219 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX4O95219 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX4O95219 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX4O95219 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX4O95219 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX4O95219 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX4O95219 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX4O95219 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms