Protein–RNA interactions for Protein: O95076

ALX3, Homeobox protein aristaless-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX3O95076 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALX3O95076 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALX3O95076 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALX3O95076 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ALX3O95076 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ALX3O95076 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALX3O95076 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALX3O95076 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALX3O95076 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALX3O95076 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALX3O95076 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALX3O95076 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ALX3O95076 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALX3O95076 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALX3O95076 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALX3O95076 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALX3O95076 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALX3O95076 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALX3O95076 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALX3O95076 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALX3O95076 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALX3O95076 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALX3O95076 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALX3O95076 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALX3O95076 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALX3O95076 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALX3O95076 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALX3O95076 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALX3O95076 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALX3O95076 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALX3O95076 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALX3O95076 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALX3O95076 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALX3O95076 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ALX3O95076 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ALX3O95076 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ALX3O95076 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALX3O95076 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALX3O95076 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALX3O95076 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALX3O95076 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALX3O95076 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALX3O95076 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALX3O95076 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALX3O95076 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALX3O95076 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALX3O95076 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALX3O95076 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ALX3O95076 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALX3O95076 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALX3O95076 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALX3O95076 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALX3O95076 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALX3O95076 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALX3O95076 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALX3O95076 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALX3O95076 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALX3O95076 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALX3O95076 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALX3O95076 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALX3O95076 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALX3O95076 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALX3O95076 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALX3O95076 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALX3O95076 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ALX3O95076 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ALX3O95076 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
ALX3O95076 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALX3O95076 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALX3O95076 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALX3O95076 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALX3O95076 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALX3O95076 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALX3O95076 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALX3O95076 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALX3O95076 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ALX3O95076 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALX3O95076 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ALX3O95076 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALX3O95076 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALX3O95076 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALX3O95076 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALX3O95076 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALX3O95076 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALX3O95076 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALX3O95076 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALX3O95076 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALX3O95076 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ALX3O95076 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ALX3O95076 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALX3O95076 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALX3O95076 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALX3O95076 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALX3O95076 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALX3O95076 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALX3O95076 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALX3O95076 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALX3O95076 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALX3O95076 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALX3O95076 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms