Protein–RNA interactions for Protein: O94929

ABLIM3, Actin-binding LIM protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABLIM3O94929 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABLIM3O94929 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABLIM3O94929 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ABLIM3O94929 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ABLIM3O94929 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABLIM3O94929 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABLIM3O94929 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABLIM3O94929 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABLIM3O94929 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABLIM3O94929 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABLIM3O94929 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ABLIM3O94929 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ABLIM3O94929 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ABLIM3O94929 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ABLIM3O94929 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ABLIM3O94929 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
ABLIM3O94929 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ABLIM3O94929 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ABLIM3O94929 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
ABLIM3O94929 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ABLIM3O94929 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ABLIM3O94929 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ABLIM3O94929 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ABLIM3O94929 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ABLIM3O94929 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
ABLIM3O94929 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ABLIM3O94929 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ABLIM3O94929 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
ABLIM3O94929 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ABLIM3O94929 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ABLIM3O94929 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ABLIM3O94929 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ABLIM3O94929 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ABLIM3O94929 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ABLIM3O94929 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
ABLIM3O94929 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABLIM3O94929 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABLIM3O94929 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABLIM3O94929 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ABLIM3O94929 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ABLIM3O94929 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ABLIM3O94929 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ABLIM3O94929 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
ABLIM3O94929 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ABLIM3O94929 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ABLIM3O94929 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ABLIM3O94929 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ABLIM3O94929 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ABLIM3O94929 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ABLIM3O94929 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ABLIM3O94929 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ABLIM3O94929 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ABLIM3O94929 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ABLIM3O94929 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ABLIM3O94929 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ABLIM3O94929 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ABLIM3O94929 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ABLIM3O94929 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ABLIM3O94929 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ABLIM3O94929 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ABLIM3O94929 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ABLIM3O94929 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ABLIM3O94929 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ABLIM3O94929 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ABLIM3O94929 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ABLIM3O94929 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ABLIM3O94929 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ABLIM3O94929 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ABLIM3O94929 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ABLIM3O94929 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
ABLIM3O94929 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ABLIM3O94929 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ABLIM3O94929 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ABLIM3O94929 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ABLIM3O94929 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ABLIM3O94929 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ABLIM3O94929 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ABLIM3O94929 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ABLIM3O94929 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ABLIM3O94929 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
ABLIM3O94929 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ABLIM3O94929 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ABLIM3O94929 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ABLIM3O94929 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ABLIM3O94929 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ABLIM3O94929 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ABLIM3O94929 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ABLIM3O94929 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ABLIM3O94929 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ABLIM3O94929 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ABLIM3O94929 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ABLIM3O94929 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ABLIM3O94929 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ABLIM3O94929 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ABLIM3O94929 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ABLIM3O94929 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ABLIM3O94929 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ABLIM3O94929 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ABLIM3O94929 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ABLIM3O94929 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms