Protein–RNA interactions for Protein: O94855

SEC24D, Protein transport protein Sec24D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24DO94855 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SEC24DO94855 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SEC24DO94855 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SEC24DO94855 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SEC24DO94855 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEC24DO94855 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEC24DO94855 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEC24DO94855 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEC24DO94855 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEC24DO94855 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEC24DO94855 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEC24DO94855 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEC24DO94855 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEC24DO94855 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEC24DO94855 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEC24DO94855 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEC24DO94855 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEC24DO94855 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEC24DO94855 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SEC24DO94855 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEC24DO94855 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEC24DO94855 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEC24DO94855 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEC24DO94855 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEC24DO94855 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEC24DO94855 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEC24DO94855 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEC24DO94855 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEC24DO94855 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEC24DO94855 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEC24DO94855 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEC24DO94855 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEC24DO94855 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEC24DO94855 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEC24DO94855 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEC24DO94855 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEC24DO94855 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEC24DO94855 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEC24DO94855 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEC24DO94855 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEC24DO94855 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEC24DO94855 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEC24DO94855 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEC24DO94855 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEC24DO94855 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEC24DO94855 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEC24DO94855 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEC24DO94855 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEC24DO94855 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEC24DO94855 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SEC24DO94855 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEC24DO94855 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEC24DO94855 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEC24DO94855 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEC24DO94855 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEC24DO94855 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEC24DO94855 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEC24DO94855 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEC24DO94855 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SEC24DO94855 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEC24DO94855 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEC24DO94855 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEC24DO94855 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEC24DO94855 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEC24DO94855 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEC24DO94855 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEC24DO94855 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEC24DO94855 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SEC24DO94855 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEC24DO94855 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEC24DO94855 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEC24DO94855 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEC24DO94855 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEC24DO94855 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEC24DO94855 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEC24DO94855 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEC24DO94855 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SEC24DO94855 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEC24DO94855 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEC24DO94855 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEC24DO94855 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEC24DO94855 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEC24DO94855 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEC24DO94855 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEC24DO94855 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEC24DO94855 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEC24DO94855 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEC24DO94855 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEC24DO94855 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SEC24DO94855 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEC24DO94855 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEC24DO94855 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEC24DO94855 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEC24DO94855 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEC24DO94855 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEC24DO94855 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEC24DO94855 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SEC24DO94855 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEC24DO94855 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEC24DO94855 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms