Protein–RNA interactions for Protein: O88974

Setdb1, Histone-lysine N-methyltransferase SETDB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setdb1O88974 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Setdb1O88974 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Setdb1O88974 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Setdb1O88974 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Setdb1O88974 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Setdb1O88974 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Setdb1O88974 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Setdb1O88974 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Setdb1O88974 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Setdb1O88974 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Setdb1O88974 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Setdb1O88974 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Setdb1O88974 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Setdb1O88974 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Setdb1O88974 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Setdb1O88974 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Setdb1O88974 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Setdb1O88974 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Setdb1O88974 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Setdb1O88974 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Setdb1O88974 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Setdb1O88974 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Setdb1O88974 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Setdb1O88974 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Setdb1O88974 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Setdb1O88974 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Setdb1O88974 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Setdb1O88974 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Setdb1O88974 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Setdb1O88974 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Setdb1O88974 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Setdb1O88974 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Setdb1O88974 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Setdb1O88974 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Setdb1O88974 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Setdb1O88974 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Setdb1O88974 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Setdb1O88974 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Setdb1O88974 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Setdb1O88974 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Setdb1O88974 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Setdb1O88974 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Setdb1O88974 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Setdb1O88974 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Setdb1O88974 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Setdb1O88974 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Setdb1O88974 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Setdb1O88974 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Setdb1O88974 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Setdb1O88974 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Setdb1O88974 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Setdb1O88974 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Setdb1O88974 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Setdb1O88974 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Setdb1O88974 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Setdb1O88974 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Setdb1O88974 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Setdb1O88974 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Setdb1O88974 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Setdb1O88974 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Setdb1O88974 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Setdb1O88974 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Setdb1O88974 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Setdb1O88974 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Setdb1O88974 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Setdb1O88974 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Setdb1O88974 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Setdb1O88974 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Setdb1O88974 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Setdb1O88974 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Setdb1O88974 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Setdb1O88974 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Setdb1O88974 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Setdb1O88974 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Setdb1O88974 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Setdb1O88974 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Setdb1O88974 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Setdb1O88974 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Setdb1O88974 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Setdb1O88974 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Setdb1O88974 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Setdb1O88974 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Setdb1O88974 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Setdb1O88974 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Setdb1O88974 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Setdb1O88974 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Setdb1O88974 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Setdb1O88974 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Setdb1O88974 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Setdb1O88974 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Setdb1O88974 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Setdb1O88974 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Setdb1O88974 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Setdb1O88974 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Setdb1O88974 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Setdb1O88974 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Setdb1O88974 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Setdb1O88974 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Setdb1O88974 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Setdb1O88974 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms