Protein–RNA interactions for Protein: O88968

Tcn2, Transcobalamin-2, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcn2O88968 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tcn2O88968 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tcn2O88968 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tcn2O88968 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tcn2O88968 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tcn2O88968 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tcn2O88968 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tcn2O88968 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tcn2O88968 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tcn2O88968 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tcn2O88968 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tcn2O88968 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tcn2O88968 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Tcn2O88968 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tcn2O88968 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tcn2O88968 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tcn2O88968 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tcn2O88968 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tcn2O88968 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tcn2O88968 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tcn2O88968 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tcn2O88968 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tcn2O88968 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tcn2O88968 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tcn2O88968 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Tcn2O88968 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tcn2O88968 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tcn2O88968 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tcn2O88968 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tcn2O88968 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tcn2O88968 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Tcn2O88968 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tcn2O88968 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Tcn2O88968 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tcn2O88968 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tcn2O88968 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tcn2O88968 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tcn2O88968 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tcn2O88968 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tcn2O88968 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tcn2O88968 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tcn2O88968 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tcn2O88968 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tcn2O88968 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tcn2O88968 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tcn2O88968 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tcn2O88968 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tcn2O88968 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tcn2O88968 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tcn2O88968 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tcn2O88968 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tcn2O88968 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tcn2O88968 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tcn2O88968 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tcn2O88968 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tcn2O88968 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tcn2O88968 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Tcn2O88968 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tcn2O88968 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tcn2O88968 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tcn2O88968 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tcn2O88968 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tcn2O88968 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tcn2O88968 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tcn2O88968 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tcn2O88968 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tcn2O88968 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tcn2O88968 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tcn2O88968 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tcn2O88968 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tcn2O88968 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tcn2O88968 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Tcn2O88968 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tcn2O88968 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tcn2O88968 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tcn2O88968 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tcn2O88968 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Tcn2O88968 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tcn2O88968 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Tcn2O88968 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tcn2O88968 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tcn2O88968 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tcn2O88968 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tcn2O88968 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tcn2O88968 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tcn2O88968 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tcn2O88968 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tcn2O88968 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tcn2O88968 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tcn2O88968 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Tcn2O88968 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tcn2O88968 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tcn2O88968 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tcn2O88968 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tcn2O88968 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tcn2O88968 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tcn2O88968 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tcn2O88968 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tcn2O88968 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tcn2O88968 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms