Protein–RNA interactions for Protein: O88207

Col5a1, Collagen alpha-1(V) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a1O88207 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Col5a1O88207 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col5a1O88207 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col5a1O88207 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col5a1O88207 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col5a1O88207 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col5a1O88207 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col5a1O88207 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col5a1O88207 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col5a1O88207 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col5a1O88207 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col5a1O88207 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col5a1O88207 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col5a1O88207 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col5a1O88207 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col5a1O88207 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col5a1O88207 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col5a1O88207 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col5a1O88207 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col5a1O88207 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Col5a1O88207 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col5a1O88207 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Col5a1O88207 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col5a1O88207 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col5a1O88207 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col5a1O88207 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col5a1O88207 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col5a1O88207 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col5a1O88207 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col5a1O88207 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col5a1O88207 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col5a1O88207 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col5a1O88207 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col5a1O88207 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col5a1O88207 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col5a1O88207 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col5a1O88207 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col5a1O88207 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col5a1O88207 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col5a1O88207 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Col5a1O88207 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Col5a1O88207 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col5a1O88207 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col5a1O88207 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col5a1O88207 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col5a1O88207 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col5a1O88207 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col5a1O88207 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col5a1O88207 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col5a1O88207 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col5a1O88207 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col5a1O88207 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col5a1O88207 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col5a1O88207 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col5a1O88207 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col5a1O88207 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col5a1O88207 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col5a1O88207 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col5a1O88207 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Col5a1O88207 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Col5a1O88207 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Col5a1O88207 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Col5a1O88207 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Col5a1O88207 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col5a1O88207 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col5a1O88207 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Col5a1O88207 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col5a1O88207 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col5a1O88207 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Col5a1O88207 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Col5a1O88207 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col5a1O88207 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col5a1O88207 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Col5a1O88207 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Col5a1O88207 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col5a1O88207 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col5a1O88207 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col5a1O88207 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col5a1O88207 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Col5a1O88207 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Col5a1O88207 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col5a1O88207 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col5a1O88207 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col5a1O88207 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col5a1O88207 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col5a1O88207 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col5a1O88207 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col5a1O88207 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col5a1O88207 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col5a1O88207 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Col5a1O88207 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Col5a1O88207 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Col5a1O88207 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col5a1O88207 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col5a1O88207 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col5a1O88207 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col5a1O88207 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col5a1O88207 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col5a1O88207 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col5a1O88207 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms