Protein–RNA interactions for Protein: O75935

DCTN3, Dynactin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN3O75935 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DCTN3O75935 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DCTN3O75935 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DCTN3O75935 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DCTN3O75935 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DCTN3O75935 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DCTN3O75935 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DCTN3O75935 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DCTN3O75935 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DCTN3O75935 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DCTN3O75935 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DCTN3O75935 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DCTN3O75935 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DCTN3O75935 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DCTN3O75935 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DCTN3O75935 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DCTN3O75935 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DCTN3O75935 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DCTN3O75935 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DCTN3O75935 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DCTN3O75935 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DCTN3O75935 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DCTN3O75935 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DCTN3O75935 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DCTN3O75935 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DCTN3O75935 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DCTN3O75935 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DCTN3O75935 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DCTN3O75935 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DCTN3O75935 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DCTN3O75935 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
DCTN3O75935 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
DCTN3O75935 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DCTN3O75935 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DCTN3O75935 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DCTN3O75935 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DCTN3O75935 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DCTN3O75935 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DCTN3O75935 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
DCTN3O75935 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DCTN3O75935 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DCTN3O75935 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DCTN3O75935 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DCTN3O75935 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DCTN3O75935 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DCTN3O75935 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DCTN3O75935 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DCTN3O75935 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DCTN3O75935 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DCTN3O75935 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DCTN3O75935 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DCTN3O75935 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DCTN3O75935 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DCTN3O75935 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DCTN3O75935 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DCTN3O75935 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DCTN3O75935 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DCTN3O75935 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
DCTN3O75935 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DCTN3O75935 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DCTN3O75935 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DCTN3O75935 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DCTN3O75935 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DCTN3O75935 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DCTN3O75935 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DCTN3O75935 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DCTN3O75935 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DCTN3O75935 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DCTN3O75935 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DCTN3O75935 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DCTN3O75935 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DCTN3O75935 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DCTN3O75935 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DCTN3O75935 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DCTN3O75935 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DCTN3O75935 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DCTN3O75935 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DCTN3O75935 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DCTN3O75935 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DCTN3O75935 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DCTN3O75935 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DCTN3O75935 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DCTN3O75935 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DCTN3O75935 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DCTN3O75935 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DCTN3O75935 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DCTN3O75935 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DCTN3O75935 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DCTN3O75935 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DCTN3O75935 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DCTN3O75935 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DCTN3O75935 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DCTN3O75935 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DCTN3O75935 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DCTN3O75935 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DCTN3O75935 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DCTN3O75935 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DCTN3O75935 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DCTN3O75935 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
DCTN3O75935 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms