Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SKAP2O75563 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SKAP2O75563 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SKAP2O75563 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SKAP2O75563 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SKAP2O75563 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SKAP2O75563 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SKAP2O75563 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SKAP2O75563 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SKAP2O75563 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SKAP2O75563 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SKAP2O75563 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SKAP2O75563 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SKAP2O75563 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SKAP2O75563 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SKAP2O75563 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SKAP2O75563 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SKAP2O75563 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SKAP2O75563 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SKAP2O75563 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SKAP2O75563 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SKAP2O75563 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SKAP2O75563 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SKAP2O75563 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SKAP2O75563 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SKAP2O75563 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SKAP2O75563 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SKAP2O75563 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SKAP2O75563 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SKAP2O75563 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SKAP2O75563 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SKAP2O75563 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SKAP2O75563 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SKAP2O75563 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SKAP2O75563 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SKAP2O75563 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SKAP2O75563 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SKAP2O75563 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SKAP2O75563 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SKAP2O75563 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SKAP2O75563 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SKAP2O75563 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SKAP2O75563 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SKAP2O75563 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SKAP2O75563 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SKAP2O75563 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SKAP2O75563 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SKAP2O75563 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SKAP2O75563 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SKAP2O75563 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SKAP2O75563 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SKAP2O75563 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SKAP2O75563 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SKAP2O75563 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SKAP2O75563 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SKAP2O75563 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SKAP2O75563 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SKAP2O75563 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SKAP2O75563 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SKAP2O75563 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SKAP2O75563 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SKAP2O75563 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SKAP2O75563 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SKAP2O75563 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SKAP2O75563 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SKAP2O75563 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SKAP2O75563 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SKAP2O75563 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SKAP2O75563 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SKAP2O75563 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SKAP2O75563 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SKAP2O75563 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SKAP2O75563 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SKAP2O75563 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SKAP2O75563 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SKAP2O75563 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SKAP2O75563 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SKAP2O75563 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SKAP2O75563 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SKAP2O75563 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SKAP2O75563 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SKAP2O75563 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SKAP2O75563 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SKAP2O75563 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SKAP2O75563 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SKAP2O75563 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SKAP2O75563 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SKAP2O75563 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SKAP2O75563 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SKAP2O75563 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SKAP2O75563 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SKAP2O75563 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SKAP2O75563 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SKAP2O75563 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SKAP2O75563 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SKAP2O75563 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SKAP2O75563 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SKAP2O75563 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SKAP2O75563 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SKAP2O75563 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms