Protein–RNA interactions for Protein: O75427

LRCH4, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH4O75427 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRCH4O75427 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRCH4O75427 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRCH4O75427 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRCH4O75427 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
LRCH4O75427 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRCH4O75427 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRCH4O75427 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRCH4O75427 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRCH4O75427 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRCH4O75427 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRCH4O75427 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRCH4O75427 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
LRCH4O75427 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRCH4O75427 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRCH4O75427 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRCH4O75427 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRCH4O75427 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRCH4O75427 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
LRCH4O75427 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRCH4O75427 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRCH4O75427 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRCH4O75427 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRCH4O75427 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRCH4O75427 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRCH4O75427 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRCH4O75427 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRCH4O75427 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRCH4O75427 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRCH4O75427 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRCH4O75427 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRCH4O75427 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRCH4O75427 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRCH4O75427 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRCH4O75427 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRCH4O75427 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
LRCH4O75427 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
LRCH4O75427 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LRCH4O75427 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRCH4O75427 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRCH4O75427 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
LRCH4O75427 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
LRCH4O75427 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRCH4O75427 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRCH4O75427 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
LRCH4O75427 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27■■□□□ 1.91
LRCH4O75427 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LRCH4O75427 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LRCH4O75427 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRCH4O75427 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRCH4O75427 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRCH4O75427 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
LRCH4O75427 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRCH4O75427 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRCH4O75427 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRCH4O75427 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRCH4O75427 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LRCH4O75427 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRCH4O75427 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRCH4O75427 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRCH4O75427 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRCH4O75427 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
LRCH4O75427 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRCH4O75427 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRCH4O75427 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRCH4O75427 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
LRCH4O75427 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRCH4O75427 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRCH4O75427 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRCH4O75427 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRCH4O75427 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRCH4O75427 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRCH4O75427 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRCH4O75427 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRCH4O75427 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LRCH4O75427 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LRCH4O75427 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LRCH4O75427 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRCH4O75427 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRCH4O75427 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRCH4O75427 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRCH4O75427 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRCH4O75427 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRCH4O75427 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRCH4O75427 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRCH4O75427 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRCH4O75427 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRCH4O75427 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRCH4O75427 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRCH4O75427 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRCH4O75427 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRCH4O75427 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRCH4O75427 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRCH4O75427 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRCH4O75427 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRCH4O75427 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
LRCH4O75427 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRCH4O75427 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRCH4O75427 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRCH4O75427 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms