Protein–RNA interactions for Protein: O75309

CDH16, Cadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH16O75309 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDH16O75309 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDH16O75309 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDH16O75309 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDH16O75309 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDH16O75309 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDH16O75309 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDH16O75309 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDH16O75309 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CDH16O75309 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDH16O75309 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDH16O75309 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDH16O75309 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDH16O75309 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDH16O75309 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CDH16O75309 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDH16O75309 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDH16O75309 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDH16O75309 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDH16O75309 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDH16O75309 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDH16O75309 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDH16O75309 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDH16O75309 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDH16O75309 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDH16O75309 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDH16O75309 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDH16O75309 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDH16O75309 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDH16O75309 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CDH16O75309 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDH16O75309 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDH16O75309 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDH16O75309 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDH16O75309 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDH16O75309 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDH16O75309 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDH16O75309 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CDH16O75309 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDH16O75309 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDH16O75309 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDH16O75309 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDH16O75309 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDH16O75309 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDH16O75309 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDH16O75309 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDH16O75309 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDH16O75309 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDH16O75309 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDH16O75309 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDH16O75309 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDH16O75309 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDH16O75309 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDH16O75309 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDH16O75309 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDH16O75309 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDH16O75309 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDH16O75309 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDH16O75309 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDH16O75309 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDH16O75309 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDH16O75309 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDH16O75309 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDH16O75309 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CDH16O75309 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
CDH16O75309 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CDH16O75309 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDH16O75309 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDH16O75309 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDH16O75309 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDH16O75309 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDH16O75309 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDH16O75309 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDH16O75309 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDH16O75309 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDH16O75309 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDH16O75309 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
CDH16O75309 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDH16O75309 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDH16O75309 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDH16O75309 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDH16O75309 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDH16O75309 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDH16O75309 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDH16O75309 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDH16O75309 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDH16O75309 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDH16O75309 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDH16O75309 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDH16O75309 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDH16O75309 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDH16O75309 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDH16O75309 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDH16O75309 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDH16O75309 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDH16O75309 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDH16O75309 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDH16O75309 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDH16O75309 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDH16O75309 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms