Protein–RNA interactions for Protein: O75208

COQ9, Ubiquinone biosynthesis protein COQ9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COQ9O75208 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COQ9O75208 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COQ9O75208 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
COQ9O75208 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
COQ9O75208 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COQ9O75208 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COQ9O75208 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COQ9O75208 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COQ9O75208 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COQ9O75208 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COQ9O75208 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COQ9O75208 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COQ9O75208 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COQ9O75208 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COQ9O75208 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COQ9O75208 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COQ9O75208 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COQ9O75208 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COQ9O75208 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COQ9O75208 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COQ9O75208 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COQ9O75208 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COQ9O75208 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
COQ9O75208 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COQ9O75208 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
COQ9O75208 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
COQ9O75208 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
COQ9O75208 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
COQ9O75208 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
COQ9O75208 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
COQ9O75208 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
COQ9O75208 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COQ9O75208 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COQ9O75208 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COQ9O75208 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COQ9O75208 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COQ9O75208 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COQ9O75208 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COQ9O75208 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COQ9O75208 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COQ9O75208 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COQ9O75208 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COQ9O75208 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COQ9O75208 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COQ9O75208 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COQ9O75208 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
COQ9O75208 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COQ9O75208 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COQ9O75208 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
COQ9O75208 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COQ9O75208 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COQ9O75208 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COQ9O75208 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COQ9O75208 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COQ9O75208 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COQ9O75208 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COQ9O75208 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
COQ9O75208 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COQ9O75208 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COQ9O75208 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COQ9O75208 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
COQ9O75208 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COQ9O75208 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COQ9O75208 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COQ9O75208 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COQ9O75208 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COQ9O75208 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COQ9O75208 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COQ9O75208 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COQ9O75208 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COQ9O75208 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COQ9O75208 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COQ9O75208 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COQ9O75208 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COQ9O75208 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COQ9O75208 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COQ9O75208 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COQ9O75208 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COQ9O75208 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COQ9O75208 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
COQ9O75208 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COQ9O75208 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COQ9O75208 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COQ9O75208 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COQ9O75208 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COQ9O75208 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COQ9O75208 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COQ9O75208 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COQ9O75208 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COQ9O75208 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COQ9O75208 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COQ9O75208 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COQ9O75208 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
COQ9O75208 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COQ9O75208 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COQ9O75208 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COQ9O75208 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
COQ9O75208 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COQ9O75208 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COQ9O75208 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms