Protein–RNA interactions for Protein: O75030

MITF, Microphthalmia-associated transcription factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MITFO75030 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MITFO75030 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
MITFO75030 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MITFO75030 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MITFO75030 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MITFO75030 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MITFO75030 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MITFO75030 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MITFO75030 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MITFO75030 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MITFO75030 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MITFO75030 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
MITFO75030 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MITFO75030 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MITFO75030 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MITFO75030 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MITFO75030 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MITFO75030 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
MITFO75030 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MITFO75030 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MITFO75030 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MITFO75030 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MITFO75030 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MITFO75030 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MITFO75030 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MITFO75030 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MITFO75030 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MITFO75030 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MITFO75030 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MITFO75030 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MITFO75030 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MITFO75030 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MITFO75030 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MITFO75030 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MITFO75030 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MITFO75030 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MITFO75030 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MITFO75030 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MITFO75030 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MITFO75030 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MITFO75030 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MITFO75030 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MITFO75030 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MITFO75030 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MITFO75030 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MITFO75030 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MITFO75030 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MITFO75030 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
MITFO75030 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MITFO75030 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MITFO75030 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MITFO75030 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MITFO75030 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MITFO75030 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MITFO75030 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
MITFO75030 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MITFO75030 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MITFO75030 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MITFO75030 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MITFO75030 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MITFO75030 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MITFO75030 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MITFO75030 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MITFO75030 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MITFO75030 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MITFO75030 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MITFO75030 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MITFO75030 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MITFO75030 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MITFO75030 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MITFO75030 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MITFO75030 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MITFO75030 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MITFO75030 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MITFO75030 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MITFO75030 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
MITFO75030 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MITFO75030 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MITFO75030 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MITFO75030 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MITFO75030 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MITFO75030 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MITFO75030 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MITFO75030 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MITFO75030 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MITFO75030 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MITFO75030 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MITFO75030 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MITFO75030 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MITFO75030 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MITFO75030 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MITFO75030 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MITFO75030 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MITFO75030 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MITFO75030 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MITFO75030 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MITFO75030 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MITFO75030 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MITFO75030 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MITFO75030 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms