Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTNSO60931 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTNSO60931 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTNSO60931 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTNSO60931 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTNSO60931 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTNSO60931 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTNSO60931 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTNSO60931 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTNSO60931 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTNSO60931 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTNSO60931 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTNSO60931 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTNSO60931 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTNSO60931 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTNSO60931 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTNSO60931 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTNSO60931 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTNSO60931 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTNSO60931 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTNSO60931 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTNSO60931 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTNSO60931 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTNSO60931 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTNSO60931 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTNSO60931 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTNSO60931 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTNSO60931 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTNSO60931 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTNSO60931 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTNSO60931 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTNSO60931 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTNSO60931 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTNSO60931 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTNSO60931 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTNSO60931 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTNSO60931 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTNSO60931 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTNSO60931 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTNSO60931 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CTNSO60931 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTNSO60931 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTNSO60931 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTNSO60931 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CTNSO60931 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTNSO60931 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTNSO60931 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTNSO60931 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTNSO60931 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTNSO60931 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTNSO60931 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTNSO60931 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTNSO60931 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTNSO60931 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTNSO60931 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTNSO60931 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTNSO60931 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTNSO60931 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CTNSO60931 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTNSO60931 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTNSO60931 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTNSO60931 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CTNSO60931 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTNSO60931 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTNSO60931 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTNSO60931 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CTNSO60931 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTNSO60931 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTNSO60931 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTNSO60931 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTNSO60931 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTNSO60931 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTNSO60931 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTNSO60931 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTNSO60931 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTNSO60931 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CTNSO60931 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CTNSO60931 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTNSO60931 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTNSO60931 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CTNSO60931 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTNSO60931 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTNSO60931 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTNSO60931 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTNSO60931 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTNSO60931 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTNSO60931 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTNSO60931 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTNSO60931 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CTNSO60931 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CTNSO60931 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTNSO60931 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTNSO60931 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTNSO60931 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTNSO60931 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTNSO60931 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTNSO60931 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTNSO60931 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTNSO60931 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTNSO60931 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms