Protein–RNA interactions for Protein: O60383

GDF9, Growth/differentiation factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF9O60383 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GDF9O60383 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GDF9O60383 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GDF9O60383 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GDF9O60383 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GDF9O60383 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GDF9O60383 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GDF9O60383 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GDF9O60383 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GDF9O60383 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GDF9O60383 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
GDF9O60383 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GDF9O60383 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GDF9O60383 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GDF9O60383 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GDF9O60383 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GDF9O60383 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GDF9O60383 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GDF9O60383 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GDF9O60383 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GDF9O60383 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GDF9O60383 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GDF9O60383 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GDF9O60383 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GDF9O60383 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GDF9O60383 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GDF9O60383 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GDF9O60383 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GDF9O60383 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GDF9O60383 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GDF9O60383 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
GDF9O60383 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GDF9O60383 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GDF9O60383 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GDF9O60383 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GDF9O60383 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GDF9O60383 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GDF9O60383 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GDF9O60383 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GDF9O60383 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GDF9O60383 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GDF9O60383 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GDF9O60383 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GDF9O60383 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GDF9O60383 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GDF9O60383 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GDF9O60383 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GDF9O60383 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GDF9O60383 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GDF9O60383 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GDF9O60383 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GDF9O60383 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GDF9O60383 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GDF9O60383 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
GDF9O60383 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GDF9O60383 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GDF9O60383 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GDF9O60383 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GDF9O60383 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GDF9O60383 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GDF9O60383 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GDF9O60383 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
GDF9O60383 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GDF9O60383 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GDF9O60383 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
GDF9O60383 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GDF9O60383 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
GDF9O60383 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GDF9O60383 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GDF9O60383 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GDF9O60383 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GDF9O60383 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GDF9O60383 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GDF9O60383 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GDF9O60383 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GDF9O60383 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
GDF9O60383 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GDF9O60383 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
GDF9O60383 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GDF9O60383 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
GDF9O60383 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GDF9O60383 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GDF9O60383 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GDF9O60383 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GDF9O60383 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GDF9O60383 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GDF9O60383 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GDF9O60383 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GDF9O60383 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GDF9O60383 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GDF9O60383 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GDF9O60383 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GDF9O60383 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GDF9O60383 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GDF9O60383 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GDF9O60383 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GDF9O60383 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GDF9O60383 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GDF9O60383 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GDF9O60383 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms