Protein–RNA interactions for Protein: O60239

SH3BP5, SH3 domain-binding protein 5, humanhuman

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Length 455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5O60239 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SH3BP5O60239 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SH3BP5O60239 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SH3BP5O60239 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SH3BP5O60239 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SH3BP5O60239 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SH3BP5O60239 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SH3BP5O60239 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SH3BP5O60239 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SH3BP5O60239 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SH3BP5O60239 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SH3BP5O60239 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SH3BP5O60239 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SH3BP5O60239 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SH3BP5O60239 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SH3BP5O60239 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SH3BP5O60239 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SH3BP5O60239 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SH3BP5O60239 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SH3BP5O60239 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SH3BP5O60239 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SH3BP5O60239 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SH3BP5O60239 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SH3BP5O60239 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SH3BP5O60239 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SH3BP5O60239 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SH3BP5O60239 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SH3BP5O60239 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SH3BP5O60239 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SH3BP5O60239 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SH3BP5O60239 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SH3BP5O60239 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SH3BP5O60239 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SH3BP5O60239 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SH3BP5O60239 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SH3BP5O60239 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SH3BP5O60239 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SH3BP5O60239 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SH3BP5O60239 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SH3BP5O60239 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SH3BP5O60239 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SH3BP5O60239 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SH3BP5O60239 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SH3BP5O60239 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SH3BP5O60239 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SH3BP5O60239 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SH3BP5O60239 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SH3BP5O60239 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SH3BP5O60239 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SH3BP5O60239 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SH3BP5O60239 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SH3BP5O60239 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SH3BP5O60239 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SH3BP5O60239 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SH3BP5O60239 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SH3BP5O60239 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SH3BP5O60239 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SH3BP5O60239 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SH3BP5O60239 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SH3BP5O60239 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SH3BP5O60239 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SH3BP5O60239 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SH3BP5O60239 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SH3BP5O60239 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SH3BP5O60239 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SH3BP5O60239 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SH3BP5O60239 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SH3BP5O60239 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SH3BP5O60239 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SH3BP5O60239 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SH3BP5O60239 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SH3BP5O60239 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SH3BP5O60239 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SH3BP5O60239 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SH3BP5O60239 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SH3BP5O60239 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SH3BP5O60239 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SH3BP5O60239 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SH3BP5O60239 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SH3BP5O60239 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SH3BP5O60239 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SH3BP5O60239 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SH3BP5O60239 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SH3BP5O60239 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SH3BP5O60239 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SH3BP5O60239 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SH3BP5O60239 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SH3BP5O60239 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SH3BP5O60239 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SH3BP5O60239 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SH3BP5O60239 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SH3BP5O60239 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SH3BP5O60239 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SH3BP5O60239 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SH3BP5O60239 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SH3BP5O60239 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SH3BP5O60239 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SH3BP5O60239 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SH3BP5O60239 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SH3BP5O60239 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
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