Protein–RNA interactions for Protein: O55144

Tlx3, T-cell leukemia homeobox protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx3O55144 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Tlx3O55144 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Tlx3O55144 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tlx3O55144 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tlx3O55144 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tlx3O55144 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tlx3O55144 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tlx3O55144 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tlx3O55144 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tlx3O55144 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Tlx3O55144 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tlx3O55144 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tlx3O55144 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tlx3O55144 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tlx3O55144 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tlx3O55144 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tlx3O55144 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tlx3O55144 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Tlx3O55144 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tlx3O55144 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tlx3O55144 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Tlx3O55144 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Tlx3O55144 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tlx3O55144 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tlx3O55144 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tlx3O55144 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tlx3O55144 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Tlx3O55144 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tlx3O55144 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tlx3O55144 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tlx3O55144 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tlx3O55144 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tlx3O55144 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Tlx3O55144 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Tlx3O55144 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tlx3O55144 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tlx3O55144 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tlx3O55144 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tlx3O55144 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tlx3O55144 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tlx3O55144 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tlx3O55144 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tlx3O55144 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tlx3O55144 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tlx3O55144 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tlx3O55144 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tlx3O55144 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tlx3O55144 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tlx3O55144 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Tlx3O55144 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tlx3O55144 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tlx3O55144 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tlx3O55144 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tlx3O55144 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tlx3O55144 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tlx3O55144 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tlx3O55144 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tlx3O55144 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tlx3O55144 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Tlx3O55144 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tlx3O55144 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tlx3O55144 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tlx3O55144 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tlx3O55144 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tlx3O55144 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tlx3O55144 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tlx3O55144 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tlx3O55144 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tlx3O55144 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tlx3O55144 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tlx3O55144 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Tlx3O55144 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tlx3O55144 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tlx3O55144 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Tlx3O55144 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tlx3O55144 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tlx3O55144 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tlx3O55144 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tlx3O55144 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tlx3O55144 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tlx3O55144 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Tlx3O55144 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Tlx3O55144 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tlx3O55144 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tlx3O55144 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tlx3O55144 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tlx3O55144 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tlx3O55144 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tlx3O55144 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tlx3O55144 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tlx3O55144 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tlx3O55144 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tlx3O55144 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tlx3O55144 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tlx3O55144 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tlx3O55144 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tlx3O55144 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tlx3O55144 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tlx3O55144 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tlx3O55144 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms