Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Copb2O55029 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Copb2O55029 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Copb2O55029 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Copb2O55029 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Copb2O55029 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Copb2O55029 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Copb2O55029 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Copb2O55029 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Copb2O55029 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Copb2O55029 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Copb2O55029 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Copb2O55029 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Copb2O55029 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Copb2O55029 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Copb2O55029 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Copb2O55029 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Copb2O55029 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Copb2O55029 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Copb2O55029 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Copb2O55029 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Copb2O55029 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Copb2O55029 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Copb2O55029 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Copb2O55029 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Copb2O55029 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Copb2O55029 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Copb2O55029 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Copb2O55029 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Copb2O55029 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Copb2O55029 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Copb2O55029 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Copb2O55029 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Copb2O55029 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Copb2O55029 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Copb2O55029 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Copb2O55029 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Copb2O55029 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Copb2O55029 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Copb2O55029 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Copb2O55029 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Copb2O55029 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Copb2O55029 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Copb2O55029 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Copb2O55029 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Copb2O55029 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Copb2O55029 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Copb2O55029 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Copb2O55029 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Copb2O55029 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Copb2O55029 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Copb2O55029 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Copb2O55029 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Copb2O55029 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Copb2O55029 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Copb2O55029 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Copb2O55029 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Copb2O55029 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Copb2O55029 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Copb2O55029 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Copb2O55029 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Copb2O55029 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Copb2O55029 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Copb2O55029 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Copb2O55029 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Copb2O55029 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Copb2O55029 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Copb2O55029 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Copb2O55029 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Copb2O55029 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Copb2O55029 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Copb2O55029 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Copb2O55029 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Copb2O55029 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Copb2O55029 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Copb2O55029 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Copb2O55029 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Copb2O55029 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Copb2O55029 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Copb2O55029 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Copb2O55029 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Copb2O55029 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Copb2O55029 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Copb2O55029 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Copb2O55029 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Copb2O55029 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Copb2O55029 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Copb2O55029 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Copb2O55029 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Copb2O55029 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Copb2O55029 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Copb2O55029 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Copb2O55029 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Copb2O55029 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Copb2O55029 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Copb2O55029 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Copb2O55029 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Copb2O55029 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Copb2O55029 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Copb2O55029 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms