Protein–RNA interactions for Protein: O54962

Banf1, Barrier-to-autointegration factor, mousemouse

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Banf1O54962 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Banf1O54962 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Banf1O54962 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Banf1O54962 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Banf1O54962 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Banf1O54962 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Banf1O54962 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Banf1O54962 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Banf1O54962 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Banf1O54962 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Banf1O54962 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Banf1O54962 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Banf1O54962 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Banf1O54962 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Banf1O54962 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Banf1O54962 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Banf1O54962 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Banf1O54962 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Banf1O54962 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Banf1O54962 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Banf1O54962 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Banf1O54962 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Banf1O54962 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Banf1O54962 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Banf1O54962 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Banf1O54962 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Banf1O54962 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Banf1O54962 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Banf1O54962 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Banf1O54962 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Banf1O54962 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Banf1O54962 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Banf1O54962 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Banf1O54962 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Banf1O54962 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Banf1O54962 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Banf1O54962 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Banf1O54962 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Banf1O54962 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Banf1O54962 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Banf1O54962 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Banf1O54962 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Banf1O54962 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Banf1O54962 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Banf1O54962 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Banf1O54962 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Banf1O54962 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Banf1O54962 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Banf1O54962 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Banf1O54962 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Banf1O54962 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Banf1O54962 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Banf1O54962 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Banf1O54962 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Banf1O54962 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Banf1O54962 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Banf1O54962 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Banf1O54962 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Banf1O54962 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Banf1O54962 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Banf1O54962 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Banf1O54962 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Banf1O54962 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Banf1O54962 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Banf1O54962 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Banf1O54962 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Banf1O54962 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Banf1O54962 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Banf1O54962 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Banf1O54962 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Banf1O54962 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Banf1O54962 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Banf1O54962 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Banf1O54962 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Banf1O54962 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Banf1O54962 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Banf1O54962 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Banf1O54962 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Banf1O54962 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Banf1O54962 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Banf1O54962 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Banf1O54962 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Banf1O54962 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Banf1O54962 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Banf1O54962 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Banf1O54962 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Banf1O54962 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Banf1O54962 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Banf1O54962 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Banf1O54962 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Banf1O54962 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Banf1O54962 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Banf1O54962 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Banf1O54962 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Banf1O54962 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Banf1O54962 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Banf1O54962 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Banf1O54962 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Banf1O54962 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Banf1O54962 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms