Protein–RNA interactions for Protein: O54724

Cavin1, Caveolae-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cavin1O54724 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cavin1O54724 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cavin1O54724 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cavin1O54724 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Cavin1O54724 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cavin1O54724 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cavin1O54724 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cavin1O54724 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cavin1O54724 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cavin1O54724 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cavin1O54724 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cavin1O54724 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cavin1O54724 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cavin1O54724 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cavin1O54724 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cavin1O54724 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cavin1O54724 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cavin1O54724 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cavin1O54724 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cavin1O54724 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cavin1O54724 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cavin1O54724 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cavin1O54724 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cavin1O54724 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cavin1O54724 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cavin1O54724 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cavin1O54724 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cavin1O54724 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cavin1O54724 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cavin1O54724 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cavin1O54724 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cavin1O54724 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cavin1O54724 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cavin1O54724 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cavin1O54724 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Cavin1O54724 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cavin1O54724 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cavin1O54724 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cavin1O54724 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cavin1O54724 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cavin1O54724 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cavin1O54724 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cavin1O54724 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cavin1O54724 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cavin1O54724 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cavin1O54724 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cavin1O54724 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cavin1O54724 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cavin1O54724 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cavin1O54724 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cavin1O54724 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cavin1O54724 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cavin1O54724 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cavin1O54724 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cavin1O54724 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cavin1O54724 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cavin1O54724 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cavin1O54724 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cavin1O54724 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cavin1O54724 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cavin1O54724 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cavin1O54724 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cavin1O54724 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cavin1O54724 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cavin1O54724 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cavin1O54724 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cavin1O54724 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cavin1O54724 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cavin1O54724 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cavin1O54724 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cavin1O54724 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Cavin1O54724 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cavin1O54724 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cavin1O54724 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Cavin1O54724 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cavin1O54724 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cavin1O54724 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cavin1O54724 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cavin1O54724 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Cavin1O54724 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cavin1O54724 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cavin1O54724 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cavin1O54724 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cavin1O54724 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Cavin1O54724 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cavin1O54724 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cavin1O54724 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cavin1O54724 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cavin1O54724 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cavin1O54724 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cavin1O54724 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cavin1O54724 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cavin1O54724 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cavin1O54724 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cavin1O54724 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cavin1O54724 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cavin1O54724 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cavin1O54724 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cavin1O54724 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cavin1O54724 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms