Protein–RNA interactions for Protein: O54709

Klrk1, NKG2-D type II integral membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klrk1O54709 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Klrk1O54709 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Klrk1O54709 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Klrk1O54709 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Klrk1O54709 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Klrk1O54709 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Klrk1O54709 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Klrk1O54709 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Klrk1O54709 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Klrk1O54709 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Klrk1O54709 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Klrk1O54709 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Klrk1O54709 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Klrk1O54709 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Klrk1O54709 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Klrk1O54709 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Klrk1O54709 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Klrk1O54709 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Klrk1O54709 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Klrk1O54709 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Klrk1O54709 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Klrk1O54709 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Klrk1O54709 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Klrk1O54709 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Klrk1O54709 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Klrk1O54709 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Klrk1O54709 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Klrk1O54709 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Klrk1O54709 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Klrk1O54709 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Klrk1O54709 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Klrk1O54709 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Klrk1O54709 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Klrk1O54709 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Klrk1O54709 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Klrk1O54709 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Klrk1O54709 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Klrk1O54709 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Klrk1O54709 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Klrk1O54709 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Klrk1O54709 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Klrk1O54709 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Klrk1O54709 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Klrk1O54709 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Klrk1O54709 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Klrk1O54709 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Klrk1O54709 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Klrk1O54709 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Klrk1O54709 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Klrk1O54709 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Klrk1O54709 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Klrk1O54709 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Klrk1O54709 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Klrk1O54709 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Klrk1O54709 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Klrk1O54709 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Klrk1O54709 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Klrk1O54709 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Klrk1O54709 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Klrk1O54709 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Klrk1O54709 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Klrk1O54709 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Klrk1O54709 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Klrk1O54709 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Klrk1O54709 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Klrk1O54709 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Klrk1O54709 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Klrk1O54709 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Klrk1O54709 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Klrk1O54709 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Klrk1O54709 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Klrk1O54709 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Klrk1O54709 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Klrk1O54709 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Klrk1O54709 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Klrk1O54709 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Klrk1O54709 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Klrk1O54709 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Klrk1O54709 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Klrk1O54709 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Klrk1O54709 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Klrk1O54709 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Klrk1O54709 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Klrk1O54709 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Klrk1O54709 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Klrk1O54709 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Klrk1O54709 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Klrk1O54709 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Klrk1O54709 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Klrk1O54709 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Klrk1O54709 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Klrk1O54709 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Klrk1O54709 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Klrk1O54709 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
Klrk1O54709 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Klrk1O54709 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Klrk1O54709 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Klrk1O54709 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Klrk1O54709 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Klrk1O54709 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms