Protein–RNA interactions for Protein: O54693

Eda, Ectodysplasin-A, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EdaO54693 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EdaO54693 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EdaO54693 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EdaO54693 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EdaO54693 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EdaO54693 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EdaO54693 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EdaO54693 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EdaO54693 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EdaO54693 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EdaO54693 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
EdaO54693 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EdaO54693 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EdaO54693 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EdaO54693 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EdaO54693 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EdaO54693 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EdaO54693 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EdaO54693 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EdaO54693 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EdaO54693 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EdaO54693 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EdaO54693 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EdaO54693 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EdaO54693 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EdaO54693 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EdaO54693 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EdaO54693 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EdaO54693 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EdaO54693 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EdaO54693 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EdaO54693 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EdaO54693 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EdaO54693 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EdaO54693 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EdaO54693 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EdaO54693 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EdaO54693 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EdaO54693 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EdaO54693 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
EdaO54693 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EdaO54693 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EdaO54693 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EdaO54693 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EdaO54693 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EdaO54693 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
EdaO54693 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EdaO54693 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EdaO54693 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EdaO54693 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
EdaO54693 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EdaO54693 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EdaO54693 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EdaO54693 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EdaO54693 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EdaO54693 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EdaO54693 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EdaO54693 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EdaO54693 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
EdaO54693 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EdaO54693 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EdaO54693 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EdaO54693 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EdaO54693 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EdaO54693 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EdaO54693 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EdaO54693 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EdaO54693 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EdaO54693 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EdaO54693 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
EdaO54693 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
EdaO54693 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EdaO54693 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EdaO54693 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
EdaO54693 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
EdaO54693 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EdaO54693 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EdaO54693 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EdaO54693 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
EdaO54693 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EdaO54693 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EdaO54693 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
EdaO54693 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EdaO54693 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EdaO54693 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EdaO54693 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EdaO54693 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
EdaO54693 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EdaO54693 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EdaO54693 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EdaO54693 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EdaO54693 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
EdaO54693 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EdaO54693 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EdaO54693 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EdaO54693 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EdaO54693 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EdaO54693 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EdaO54693 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
EdaO54693 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms