Protein–RNA interactions for Protein: O43933

PEX1, Peroxisome biogenesis factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX1O43933 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PEX1O43933 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PEX1O43933 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PEX1O43933 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PEX1O43933 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PEX1O43933 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PEX1O43933 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PEX1O43933 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PEX1O43933 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PEX1O43933 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PEX1O43933 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PEX1O43933 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PEX1O43933 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PEX1O43933 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PEX1O43933 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PEX1O43933 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PEX1O43933 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PEX1O43933 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PEX1O43933 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PEX1O43933 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PEX1O43933 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PEX1O43933 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PEX1O43933 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PEX1O43933 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PEX1O43933 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PEX1O43933 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PEX1O43933 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PEX1O43933 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PEX1O43933 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PEX1O43933 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PEX1O43933 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PEX1O43933 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PEX1O43933 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PEX1O43933 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PEX1O43933 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PEX1O43933 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PEX1O43933 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PEX1O43933 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PEX1O43933 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PEX1O43933 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PEX1O43933 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PEX1O43933 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PEX1O43933 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PEX1O43933 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PEX1O43933 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PEX1O43933 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PEX1O43933 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PEX1O43933 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PEX1O43933 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PEX1O43933 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PEX1O43933 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PEX1O43933 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PEX1O43933 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PEX1O43933 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PEX1O43933 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PEX1O43933 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PEX1O43933 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PEX1O43933 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PEX1O43933 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PEX1O43933 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PEX1O43933 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PEX1O43933 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PEX1O43933 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PEX1O43933 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PEX1O43933 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PEX1O43933 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PEX1O43933 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PEX1O43933 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PEX1O43933 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PEX1O43933 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PEX1O43933 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PEX1O43933 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PEX1O43933 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PEX1O43933 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PEX1O43933 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PEX1O43933 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PEX1O43933 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PEX1O43933 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PEX1O43933 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PEX1O43933 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PEX1O43933 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PEX1O43933 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PEX1O43933 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PEX1O43933 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PEX1O43933 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PEX1O43933 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PEX1O43933 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PEX1O43933 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PEX1O43933 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PEX1O43933 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PEX1O43933 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PEX1O43933 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PEX1O43933 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PEX1O43933 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PEX1O43933 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PEX1O43933 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PEX1O43933 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PEX1O43933 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PEX1O43933 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PEX1O43933 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.8 ms