Protein–RNA interactions for Protein: O43900

PRICKLE3, Prickle planar cell polarity protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRICKLE3O43900 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PRICKLE3O43900 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRICKLE3O43900 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRICKLE3O43900 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRICKLE3O43900 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRICKLE3O43900 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRICKLE3O43900 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRICKLE3O43900 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRICKLE3O43900 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRICKLE3O43900 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRICKLE3O43900 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRICKLE3O43900 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRICKLE3O43900 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRICKLE3O43900 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRICKLE3O43900 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRICKLE3O43900 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRICKLE3O43900 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRICKLE3O43900 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRICKLE3O43900 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRICKLE3O43900 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRICKLE3O43900 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRICKLE3O43900 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRICKLE3O43900 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRICKLE3O43900 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRICKLE3O43900 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRICKLE3O43900 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRICKLE3O43900 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRICKLE3O43900 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRICKLE3O43900 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRICKLE3O43900 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRICKLE3O43900 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PRICKLE3O43900 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRICKLE3O43900 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRICKLE3O43900 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRICKLE3O43900 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRICKLE3O43900 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PRICKLE3O43900 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRICKLE3O43900 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRICKLE3O43900 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRICKLE3O43900 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRICKLE3O43900 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRICKLE3O43900 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRICKLE3O43900 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRICKLE3O43900 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRICKLE3O43900 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRICKLE3O43900 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRICKLE3O43900 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRICKLE3O43900 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRICKLE3O43900 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PRICKLE3O43900 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRICKLE3O43900 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRICKLE3O43900 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRICKLE3O43900 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PRICKLE3O43900 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRICKLE3O43900 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRICKLE3O43900 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRICKLE3O43900 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PRICKLE3O43900 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRICKLE3O43900 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRICKLE3O43900 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRICKLE3O43900 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRICKLE3O43900 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRICKLE3O43900 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRICKLE3O43900 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRICKLE3O43900 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRICKLE3O43900 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRICKLE3O43900 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PRICKLE3O43900 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRICKLE3O43900 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRICKLE3O43900 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PRICKLE3O43900 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRICKLE3O43900 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRICKLE3O43900 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRICKLE3O43900 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRICKLE3O43900 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PRICKLE3O43900 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRICKLE3O43900 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRICKLE3O43900 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRICKLE3O43900 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRICKLE3O43900 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRICKLE3O43900 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRICKLE3O43900 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRICKLE3O43900 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRICKLE3O43900 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRICKLE3O43900 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRICKLE3O43900 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRICKLE3O43900 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PRICKLE3O43900 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
PRICKLE3O43900 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRICKLE3O43900 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRICKLE3O43900 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRICKLE3O43900 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRICKLE3O43900 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRICKLE3O43900 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRICKLE3O43900 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRICKLE3O43900 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PRICKLE3O43900 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PRICKLE3O43900 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PRICKLE3O43900 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRICKLE3O43900 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 2153.5 ms