Protein–RNA interactions for Protein: O43791

SPOP, Speckle-type POZ protein, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOPO43791 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SPOPO43791 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SPOPO43791 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SPOPO43791 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SPOPO43791 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SPOPO43791 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SPOPO43791 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SPOPO43791 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SPOPO43791 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SPOPO43791 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SPOPO43791 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SPOPO43791 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SPOPO43791 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SPOPO43791 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPOPO43791 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPOPO43791 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPOPO43791 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPOPO43791 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SPOPO43791 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SPOPO43791 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SPOPO43791 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SPOPO43791 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SPOPO43791 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SPOPO43791 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SPOPO43791 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SPOPO43791 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SPOPO43791 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SPOPO43791 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SPOPO43791 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SPOPO43791 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SPOPO43791 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SPOPO43791 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SPOPO43791 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SPOPO43791 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SPOPO43791 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SPOPO43791 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SPOPO43791 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SPOPO43791 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SPOPO43791 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SPOPO43791 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SPOPO43791 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SPOPO43791 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SPOPO43791 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SPOPO43791 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SPOPO43791 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SPOPO43791 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPOPO43791 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPOPO43791 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPOPO43791 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPOPO43791 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SPOPO43791 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SPOPO43791 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SPOPO43791 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SPOPO43791 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SPOPO43791 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SPOPO43791 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SPOPO43791 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SPOPO43791 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SPOPO43791 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SPOPO43791 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SPOPO43791 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SPOPO43791 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SPOPO43791 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SPOPO43791 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SPOPO43791 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SPOPO43791 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SPOPO43791 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SPOPO43791 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SPOPO43791 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SPOPO43791 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SPOPO43791 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SPOPO43791 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SPOPO43791 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SPOPO43791 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SPOPO43791 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SPOPO43791 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SPOPO43791 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SPOPO43791 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SPOPO43791 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SPOPO43791 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SPOPO43791 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SPOPO43791 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SPOPO43791 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SPOPO43791 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SPOPO43791 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SPOPO43791 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SPOPO43791 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SPOPO43791 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SPOPO43791 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SPOPO43791 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SPOPO43791 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SPOPO43791 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SPOPO43791 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SPOPO43791 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SPOPO43791 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SPOPO43791 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SPOPO43791 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SPOPO43791 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SPOPO43791 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SPOPO43791 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 224.8 ms