Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYNGR2O43760 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYNGR2O43760 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYNGR2O43760 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYNGR2O43760 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYNGR2O43760 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYNGR2O43760 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYNGR2O43760 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYNGR2O43760 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYNGR2O43760 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYNGR2O43760 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYNGR2O43760 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYNGR2O43760 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SYNGR2O43760 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SYNGR2O43760 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SYNGR2O43760 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SYNGR2O43760 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYNGR2O43760 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SYNGR2O43760 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SYNGR2O43760 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SYNGR2O43760 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SYNGR2O43760 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SYNGR2O43760 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SYNGR2O43760 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SYNGR2O43760 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SYNGR2O43760 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SYNGR2O43760 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SYNGR2O43760 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SYNGR2O43760 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SYNGR2O43760 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SYNGR2O43760 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SYNGR2O43760 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SYNGR2O43760 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SYNGR2O43760 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SYNGR2O43760 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SYNGR2O43760 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SYNGR2O43760 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SYNGR2O43760 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SYNGR2O43760 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SYNGR2O43760 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SYNGR2O43760 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SYNGR2O43760 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SYNGR2O43760 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SYNGR2O43760 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SYNGR2O43760 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SYNGR2O43760 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SYNGR2O43760 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SYNGR2O43760 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SYNGR2O43760 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SYNGR2O43760 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYNGR2O43760 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYNGR2O43760 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYNGR2O43760 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SYNGR2O43760 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYNGR2O43760 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYNGR2O43760 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYNGR2O43760 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SYNGR2O43760 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYNGR2O43760 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYNGR2O43760 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYNGR2O43760 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYNGR2O43760 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYNGR2O43760 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYNGR2O43760 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYNGR2O43760 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYNGR2O43760 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYNGR2O43760 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYNGR2O43760 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYNGR2O43760 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYNGR2O43760 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYNGR2O43760 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYNGR2O43760 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYNGR2O43760 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYNGR2O43760 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYNGR2O43760 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SYNGR2O43760 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SYNGR2O43760 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SYNGR2O43760 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SYNGR2O43760 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYNGR2O43760 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYNGR2O43760 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYNGR2O43760 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYNGR2O43760 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYNGR2O43760 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYNGR2O43760 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYNGR2O43760 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYNGR2O43760 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYNGR2O43760 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYNGR2O43760 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYNGR2O43760 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYNGR2O43760 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYNGR2O43760 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SYNGR2O43760 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYNGR2O43760 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYNGR2O43760 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYNGR2O43760 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYNGR2O43760 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYNGR2O43760 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYNGR2O43760 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYNGR2O43760 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms