Protein–RNA interactions for Protein: O43439

CBFA2T2, Protein CBFA2T2, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFA2T2O43439 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CBFA2T2O43439 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CBFA2T2O43439 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CBFA2T2O43439 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CBFA2T2O43439 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CBFA2T2O43439 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CBFA2T2O43439 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CBFA2T2O43439 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CBFA2T2O43439 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CBFA2T2O43439 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CBFA2T2O43439 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CBFA2T2O43439 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CBFA2T2O43439 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CBFA2T2O43439 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CBFA2T2O43439 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CBFA2T2O43439 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CBFA2T2O43439 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CBFA2T2O43439 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CBFA2T2O43439 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CBFA2T2O43439 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CBFA2T2O43439 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CBFA2T2O43439 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CBFA2T2O43439 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CBFA2T2O43439 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CBFA2T2O43439 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CBFA2T2O43439 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CBFA2T2O43439 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CBFA2T2O43439 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CBFA2T2O43439 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CBFA2T2O43439 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CBFA2T2O43439 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CBFA2T2O43439 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CBFA2T2O43439 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CBFA2T2O43439 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CBFA2T2O43439 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CBFA2T2O43439 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CBFA2T2O43439 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CBFA2T2O43439 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CBFA2T2O43439 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CBFA2T2O43439 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CBFA2T2O43439 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CBFA2T2O43439 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CBFA2T2O43439 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CBFA2T2O43439 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CBFA2T2O43439 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CBFA2T2O43439 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CBFA2T2O43439 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CBFA2T2O43439 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CBFA2T2O43439 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CBFA2T2O43439 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CBFA2T2O43439 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CBFA2T2O43439 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CBFA2T2O43439 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CBFA2T2O43439 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CBFA2T2O43439 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CBFA2T2O43439 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CBFA2T2O43439 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CBFA2T2O43439 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CBFA2T2O43439 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CBFA2T2O43439 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CBFA2T2O43439 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CBFA2T2O43439 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CBFA2T2O43439 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CBFA2T2O43439 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CBFA2T2O43439 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CBFA2T2O43439 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CBFA2T2O43439 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CBFA2T2O43439 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CBFA2T2O43439 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CBFA2T2O43439 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CBFA2T2O43439 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CBFA2T2O43439 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CBFA2T2O43439 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
CBFA2T2O43439 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CBFA2T2O43439 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CBFA2T2O43439 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CBFA2T2O43439 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CBFA2T2O43439 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CBFA2T2O43439 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CBFA2T2O43439 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CBFA2T2O43439 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CBFA2T2O43439 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CBFA2T2O43439 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CBFA2T2O43439 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CBFA2T2O43439 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CBFA2T2O43439 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CBFA2T2O43439 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CBFA2T2O43439 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CBFA2T2O43439 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CBFA2T2O43439 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CBFA2T2O43439 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CBFA2T2O43439 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CBFA2T2O43439 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CBFA2T2O43439 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CBFA2T2O43439 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CBFA2T2O43439 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CBFA2T2O43439 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CBFA2T2O43439 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CBFA2T2O43439 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CBFA2T2O43439 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms