Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXA3O43365 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXA3O43365 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXA3O43365 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXA3O43365 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXA3O43365 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXA3O43365 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXA3O43365 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXA3O43365 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXA3O43365 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXA3O43365 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXA3O43365 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXA3O43365 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXA3O43365 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXA3O43365 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXA3O43365 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXA3O43365 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXA3O43365 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXA3O43365 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
HOXA3O43365 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXA3O43365 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXA3O43365 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXA3O43365 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXA3O43365 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXA3O43365 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXA3O43365 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXA3O43365 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXA3O43365 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXA3O43365 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXA3O43365 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXA3O43365 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXA3O43365 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXA3O43365 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXA3O43365 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXA3O43365 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXA3O43365 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXA3O43365 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXA3O43365 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXA3O43365 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXA3O43365 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXA3O43365 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXA3O43365 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXA3O43365 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXA3O43365 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXA3O43365 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXA3O43365 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXA3O43365 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXA3O43365 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXA3O43365 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXA3O43365 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXA3O43365 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXA3O43365 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXA3O43365 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXA3O43365 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXA3O43365 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXA3O43365 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXA3O43365 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXA3O43365 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXA3O43365 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXA3O43365 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXA3O43365 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXA3O43365 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXA3O43365 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXA3O43365 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXA3O43365 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXA3O43365 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXA3O43365 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXA3O43365 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXA3O43365 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXA3O43365 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXA3O43365 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXA3O43365 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXA3O43365 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXA3O43365 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXA3O43365 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXA3O43365 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXA3O43365 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXA3O43365 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXA3O43365 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXA3O43365 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXA3O43365 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXA3O43365 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXA3O43365 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXA3O43365 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXA3O43365 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXA3O43365 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXA3O43365 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXA3O43365 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXA3O43365 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXA3O43365 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXA3O43365 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXA3O43365 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXA3O43365 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXA3O43365 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXA3O43365 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXA3O43365 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
HOXA3O43365 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HOXA3O43365 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HOXA3O43365 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HOXA3O43365 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.3 ms