Protein–RNA interactions for Protein: O43325

LYRM1, LYR motif-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYRM1O43325 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LYRM1O43325 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LYRM1O43325 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LYRM1O43325 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LYRM1O43325 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LYRM1O43325 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LYRM1O43325 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LYRM1O43325 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LYRM1O43325 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LYRM1O43325 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LYRM1O43325 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LYRM1O43325 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LYRM1O43325 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LYRM1O43325 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LYRM1O43325 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LYRM1O43325 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LYRM1O43325 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LYRM1O43325 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LYRM1O43325 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LYRM1O43325 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LYRM1O43325 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LYRM1O43325 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LYRM1O43325 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LYRM1O43325 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LYRM1O43325 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LYRM1O43325 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LYRM1O43325 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LYRM1O43325 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LYRM1O43325 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LYRM1O43325 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LYRM1O43325 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LYRM1O43325 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LYRM1O43325 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LYRM1O43325 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LYRM1O43325 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LYRM1O43325 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LYRM1O43325 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LYRM1O43325 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LYRM1O43325 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LYRM1O43325 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LYRM1O43325 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LYRM1O43325 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LYRM1O43325 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LYRM1O43325 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LYRM1O43325 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LYRM1O43325 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LYRM1O43325 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LYRM1O43325 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LYRM1O43325 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LYRM1O43325 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LYRM1O43325 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LYRM1O43325 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LYRM1O43325 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LYRM1O43325 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LYRM1O43325 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LYRM1O43325 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LYRM1O43325 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LYRM1O43325 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LYRM1O43325 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LYRM1O43325 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LYRM1O43325 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LYRM1O43325 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LYRM1O43325 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LYRM1O43325 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LYRM1O43325 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LYRM1O43325 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LYRM1O43325 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LYRM1O43325 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LYRM1O43325 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LYRM1O43325 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LYRM1O43325 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LYRM1O43325 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LYRM1O43325 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LYRM1O43325 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LYRM1O43325 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LYRM1O43325 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LYRM1O43325 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LYRM1O43325 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LYRM1O43325 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LYRM1O43325 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LYRM1O43325 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LYRM1O43325 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LYRM1O43325 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LYRM1O43325 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LYRM1O43325 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LYRM1O43325 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LYRM1O43325 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LYRM1O43325 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LYRM1O43325 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LYRM1O43325 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LYRM1O43325 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LYRM1O43325 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LYRM1O43325 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LYRM1O43325 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LYRM1O43325 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LYRM1O43325 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LYRM1O43325 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LYRM1O43325 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LYRM1O43325 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LYRM1O43325 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms