Protein–RNA interactions for Protein: O35664

Ifnar2, Interferon alpha/beta receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnar2O35664 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ifnar2O35664 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ifnar2O35664 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ifnar2O35664 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ifnar2O35664 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ifnar2O35664 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ifnar2O35664 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Ifnar2O35664 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ifnar2O35664 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ifnar2O35664 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ifnar2O35664 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ifnar2O35664 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ifnar2O35664 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ifnar2O35664 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ifnar2O35664 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ifnar2O35664 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ifnar2O35664 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ifnar2O35664 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ifnar2O35664 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ifnar2O35664 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ifnar2O35664 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ifnar2O35664 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ifnar2O35664 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ifnar2O35664 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ifnar2O35664 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ifnar2O35664 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ifnar2O35664 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ifnar2O35664 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ifnar2O35664 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ifnar2O35664 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ifnar2O35664 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ifnar2O35664 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ifnar2O35664 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ifnar2O35664 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ifnar2O35664 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ifnar2O35664 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ifnar2O35664 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ifnar2O35664 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ifnar2O35664 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Ifnar2O35664 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ifnar2O35664 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ifnar2O35664 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ifnar2O35664 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ifnar2O35664 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ifnar2O35664 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ifnar2O35664 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ifnar2O35664 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ifnar2O35664 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ifnar2O35664 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ifnar2O35664 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ifnar2O35664 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ifnar2O35664 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ifnar2O35664 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ifnar2O35664 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ifnar2O35664 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ifnar2O35664 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ifnar2O35664 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ifnar2O35664 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ifnar2O35664 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ifnar2O35664 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ifnar2O35664 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ifnar2O35664 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ifnar2O35664 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ifnar2O35664 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ifnar2O35664 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ifnar2O35664 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ifnar2O35664 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ifnar2O35664 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ifnar2O35664 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ifnar2O35664 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ifnar2O35664 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ifnar2O35664 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ifnar2O35664 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ifnar2O35664 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ifnar2O35664 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ifnar2O35664 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ifnar2O35664 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ifnar2O35664 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ifnar2O35664 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ifnar2O35664 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ifnar2O35664 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ifnar2O35664 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ifnar2O35664 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ifnar2O35664 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ifnar2O35664 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ifnar2O35664 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ifnar2O35664 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ifnar2O35664 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ifnar2O35664 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ifnar2O35664 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ifnar2O35664 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ifnar2O35664 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ifnar2O35664 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ifnar2O35664 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ifnar2O35664 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ifnar2O35664 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ifnar2O35664 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ifnar2O35664 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ifnar2O35664 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Ifnar2O35664 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127.5 ms