Protein–RNA interactions for Protein: O35602

Rax, Retinal homeobox protein Rx, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RaxO35602 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RaxO35602 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RaxO35602 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RaxO35602 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RaxO35602 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RaxO35602 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RaxO35602 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RaxO35602 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RaxO35602 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RaxO35602 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RaxO35602 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RaxO35602 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RaxO35602 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RaxO35602 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RaxO35602 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RaxO35602 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RaxO35602 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RaxO35602 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RaxO35602 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RaxO35602 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RaxO35602 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RaxO35602 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RaxO35602 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RaxO35602 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RaxO35602 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RaxO35602 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RaxO35602 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RaxO35602 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RaxO35602 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RaxO35602 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RaxO35602 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RaxO35602 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RaxO35602 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RaxO35602 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RaxO35602 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RaxO35602 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RaxO35602 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RaxO35602 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RaxO35602 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RaxO35602 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RaxO35602 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RaxO35602 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RaxO35602 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RaxO35602 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RaxO35602 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RaxO35602 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RaxO35602 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RaxO35602 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RaxO35602 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RaxO35602 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RaxO35602 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RaxO35602 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RaxO35602 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RaxO35602 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RaxO35602 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RaxO35602 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RaxO35602 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RaxO35602 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RaxO35602 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RaxO35602 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RaxO35602 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RaxO35602 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RaxO35602 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RaxO35602 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RaxO35602 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RaxO35602 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RaxO35602 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RaxO35602 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RaxO35602 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RaxO35602 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RaxO35602 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RaxO35602 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RaxO35602 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RaxO35602 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RaxO35602 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RaxO35602 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RaxO35602 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RaxO35602 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RaxO35602 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RaxO35602 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RaxO35602 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RaxO35602 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RaxO35602 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RaxO35602 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RaxO35602 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RaxO35602 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RaxO35602 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RaxO35602 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RaxO35602 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RaxO35602 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RaxO35602 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RaxO35602 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RaxO35602 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RaxO35602 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RaxO35602 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RaxO35602 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RaxO35602 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RaxO35602 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RaxO35602 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RaxO35602 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms