Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

Predictions only

Length 4,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnxbO35452 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TnxbO35452 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TnxbO35452 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TnxbO35452 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TnxbO35452 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TnxbO35452 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TnxbO35452 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TnxbO35452 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TnxbO35452 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TnxbO35452 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TnxbO35452 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TnxbO35452 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TnxbO35452 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TnxbO35452 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TnxbO35452 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TnxbO35452 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TnxbO35452 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TnxbO35452 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TnxbO35452 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TnxbO35452 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TnxbO35452 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TnxbO35452 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TnxbO35452 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TnxbO35452 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TnxbO35452 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TnxbO35452 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TnxbO35452 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TnxbO35452 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TnxbO35452 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TnxbO35452 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TnxbO35452 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TnxbO35452 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TnxbO35452 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TnxbO35452 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TnxbO35452 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TnxbO35452 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TnxbO35452 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TnxbO35452 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TnxbO35452 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TnxbO35452 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TnxbO35452 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TnxbO35452 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TnxbO35452 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TnxbO35452 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TnxbO35452 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TnxbO35452 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TnxbO35452 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TnxbO35452 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TnxbO35452 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TnxbO35452 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TnxbO35452 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TnxbO35452 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TnxbO35452 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TnxbO35452 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TnxbO35452 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TnxbO35452 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TnxbO35452 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TnxbO35452 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TnxbO35452 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TnxbO35452 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TnxbO35452 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TnxbO35452 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TnxbO35452 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TnxbO35452 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TnxbO35452 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TnxbO35452 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TnxbO35452 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TnxbO35452 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TnxbO35452 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TnxbO35452 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TnxbO35452 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TnxbO35452 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TnxbO35452 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TnxbO35452 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TnxbO35452 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TnxbO35452 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TnxbO35452 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TnxbO35452 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TnxbO35452 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TnxbO35452 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TnxbO35452 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TnxbO35452 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TnxbO35452 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TnxbO35452 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TnxbO35452 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TnxbO35452 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TnxbO35452 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TnxbO35452 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TnxbO35452 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TnxbO35452 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TnxbO35452 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TnxbO35452 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TnxbO35452 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TnxbO35452 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TnxbO35452 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TnxbO35452 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TnxbO35452 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TnxbO35452 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TnxbO35452 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TnxbO35452 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.5 ms