Protein–RNA interactions for Protein: O35424

H2-Ob, Histocompatibility 2, O region beta locus, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-ObO35424 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2-ObO35424 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2-ObO35424 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2-ObO35424 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2-ObO35424 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2-ObO35424 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
H2-ObO35424 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2-ObO35424 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2-ObO35424 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2-ObO35424 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
H2-ObO35424 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
H2-ObO35424 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
H2-ObO35424 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H2-ObO35424 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H2-ObO35424 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H2-ObO35424 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H2-ObO35424 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
H2-ObO35424 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H2-ObO35424 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
H2-ObO35424 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H2-ObO35424 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H2-ObO35424 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H2-ObO35424 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H2-ObO35424 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H2-ObO35424 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H2-ObO35424 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
H2-ObO35424 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
H2-ObO35424 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H2-ObO35424 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H2-ObO35424 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H2-ObO35424 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2-ObO35424 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2-ObO35424 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2-ObO35424 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2-ObO35424 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2-ObO35424 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
H2-ObO35424 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2-ObO35424 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2-ObO35424 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2-ObO35424 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2-ObO35424 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2-ObO35424 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2-ObO35424 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2-ObO35424 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H2-ObO35424 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
H2-ObO35424 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2-ObO35424 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2-ObO35424 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2-ObO35424 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2-ObO35424 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2-ObO35424 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2-ObO35424 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
H2-ObO35424 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2-ObO35424 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2-ObO35424 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2-ObO35424 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2-ObO35424 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2-ObO35424 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2-ObO35424 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H2-ObO35424 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H2-ObO35424 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H2-ObO35424 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
H2-ObO35424 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2-ObO35424 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
H2-ObO35424 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2-ObO35424 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2-ObO35424 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
H2-ObO35424 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
H2-ObO35424 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
H2-ObO35424 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
H2-ObO35424 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
H2-ObO35424 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
H2-ObO35424 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
H2-ObO35424 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
H2-ObO35424 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
H2-ObO35424 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H2-ObO35424 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H2-ObO35424 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
H2-ObO35424 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
H2-ObO35424 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H2-ObO35424 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H2-ObO35424 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
H2-ObO35424 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H2-ObO35424 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H2-ObO35424 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H2-ObO35424 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H2-ObO35424 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
H2-ObO35424 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.29■■□□□ 1
H2-ObO35424 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H2-ObO35424 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
H2-ObO35424 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
H2-ObO35424 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H2-ObO35424 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H2-ObO35424 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H2-ObO35424 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H2-ObO35424 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
H2-ObO35424 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H2-ObO35424 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
H2-ObO35424 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
H2-ObO35424 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms