Protein–RNA interactions for Protein: O35188

Cx3cl1, Fractalkine, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cx3cl1O35188 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cx3cl1O35188 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cx3cl1O35188 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cx3cl1O35188 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cx3cl1O35188 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cx3cl1O35188 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cx3cl1O35188 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cx3cl1O35188 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cx3cl1O35188 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cx3cl1O35188 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cx3cl1O35188 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cx3cl1O35188 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cx3cl1O35188 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cx3cl1O35188 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cx3cl1O35188 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cx3cl1O35188 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cx3cl1O35188 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cx3cl1O35188 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cx3cl1O35188 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cx3cl1O35188 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cx3cl1O35188 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cx3cl1O35188 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cx3cl1O35188 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cx3cl1O35188 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cx3cl1O35188 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cx3cl1O35188 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cx3cl1O35188 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cx3cl1O35188 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Cx3cl1O35188 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cx3cl1O35188 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cx3cl1O35188 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cx3cl1O35188 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cx3cl1O35188 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cx3cl1O35188 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cx3cl1O35188 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cx3cl1O35188 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cx3cl1O35188 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cx3cl1O35188 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cx3cl1O35188 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cx3cl1O35188 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cx3cl1O35188 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cx3cl1O35188 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cx3cl1O35188 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cx3cl1O35188 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cx3cl1O35188 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cx3cl1O35188 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cx3cl1O35188 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cx3cl1O35188 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cx3cl1O35188 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cx3cl1O35188 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cx3cl1O35188 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cx3cl1O35188 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cx3cl1O35188 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cx3cl1O35188 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cx3cl1O35188 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cx3cl1O35188 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cx3cl1O35188 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cx3cl1O35188 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cx3cl1O35188 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cx3cl1O35188 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cx3cl1O35188 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cx3cl1O35188 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cx3cl1O35188 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cx3cl1O35188 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cx3cl1O35188 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cx3cl1O35188 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cx3cl1O35188 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cx3cl1O35188 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cx3cl1O35188 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cx3cl1O35188 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cx3cl1O35188 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cx3cl1O35188 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cx3cl1O35188 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cx3cl1O35188 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cx3cl1O35188 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cx3cl1O35188 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cx3cl1O35188 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cx3cl1O35188 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cx3cl1O35188 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cx3cl1O35188 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cx3cl1O35188 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cx3cl1O35188 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cx3cl1O35188 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cx3cl1O35188 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cx3cl1O35188 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cx3cl1O35188 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cx3cl1O35188 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cx3cl1O35188 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cx3cl1O35188 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cx3cl1O35188 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cx3cl1O35188 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cx3cl1O35188 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cx3cl1O35188 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cx3cl1O35188 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cx3cl1O35188 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cx3cl1O35188 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cx3cl1O35188 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cx3cl1O35188 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cx3cl1O35188 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cx3cl1O35188 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms