Protein–RNA interactions for Protein: O35181

Nrg3, Pro-neuregulin-3, membrane-bound isoform, mousemouse

Predictions only

Length 713 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrg3O35181 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nrg3O35181 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nrg3O35181 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nrg3O35181 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nrg3O35181 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nrg3O35181 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nrg3O35181 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nrg3O35181 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nrg3O35181 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nrg3O35181 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nrg3O35181 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nrg3O35181 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nrg3O35181 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nrg3O35181 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nrg3O35181 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nrg3O35181 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nrg3O35181 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nrg3O35181 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nrg3O35181 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nrg3O35181 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nrg3O35181 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nrg3O35181 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nrg3O35181 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nrg3O35181 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nrg3O35181 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nrg3O35181 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nrg3O35181 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nrg3O35181 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nrg3O35181 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nrg3O35181 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nrg3O35181 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nrg3O35181 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nrg3O35181 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Nrg3O35181 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nrg3O35181 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nrg3O35181 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nrg3O35181 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nrg3O35181 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nrg3O35181 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nrg3O35181 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nrg3O35181 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nrg3O35181 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nrg3O35181 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nrg3O35181 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nrg3O35181 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nrg3O35181 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nrg3O35181 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nrg3O35181 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nrg3O35181 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nrg3O35181 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nrg3O35181 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nrg3O35181 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Nrg3O35181 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nrg3O35181 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nrg3O35181 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nrg3O35181 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nrg3O35181 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nrg3O35181 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nrg3O35181 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nrg3O35181 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nrg3O35181 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nrg3O35181 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nrg3O35181 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nrg3O35181 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nrg3O35181 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nrg3O35181 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nrg3O35181 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nrg3O35181 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nrg3O35181 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nrg3O35181 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nrg3O35181 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nrg3O35181 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nrg3O35181 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nrg3O35181 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nrg3O35181 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nrg3O35181 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nrg3O35181 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nrg3O35181 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nrg3O35181 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nrg3O35181 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nrg3O35181 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nrg3O35181 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nrg3O35181 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nrg3O35181 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nrg3O35181 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nrg3O35181 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nrg3O35181 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nrg3O35181 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nrg3O35181 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nrg3O35181 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nrg3O35181 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nrg3O35181 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nrg3O35181 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Nrg3O35181 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nrg3O35181 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nrg3O35181 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nrg3O35181 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Nrg3O35181 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nrg3O35181 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nrg3O35181 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms