Protein–RNA interactions for Protein: O15553

MEFV, Pyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEFVO15553 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MEFVO15553 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MEFVO15553 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MEFVO15553 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MEFVO15553 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MEFVO15553 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MEFVO15553 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MEFVO15553 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MEFVO15553 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MEFVO15553 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MEFVO15553 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MEFVO15553 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
MEFVO15553 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MEFVO15553 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MEFVO15553 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MEFVO15553 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MEFVO15553 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MEFVO15553 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MEFVO15553 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
MEFVO15553 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MEFVO15553 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MEFVO15553 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MEFVO15553 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MEFVO15553 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MEFVO15553 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MEFVO15553 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MEFVO15553 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MEFVO15553 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MEFVO15553 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MEFVO15553 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MEFVO15553 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MEFVO15553 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MEFVO15553 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MEFVO15553 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MEFVO15553 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MEFVO15553 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MEFVO15553 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MEFVO15553 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MEFVO15553 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MEFVO15553 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MEFVO15553 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MEFVO15553 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MEFVO15553 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MEFVO15553 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
MEFVO15553 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
MEFVO15553 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MEFVO15553 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MEFVO15553 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MEFVO15553 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MEFVO15553 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
MEFVO15553 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MEFVO15553 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
MEFVO15553 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MEFVO15553 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MEFVO15553 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MEFVO15553 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MEFVO15553 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
MEFVO15553 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
MEFVO15553 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
MEFVO15553 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MEFVO15553 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MEFVO15553 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MEFVO15553 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MEFVO15553 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MEFVO15553 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MEFVO15553 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MEFVO15553 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MEFVO15553 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MEFVO15553 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MEFVO15553 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MEFVO15553 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MEFVO15553 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MEFVO15553 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MEFVO15553 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MEFVO15553 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MEFVO15553 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MEFVO15553 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MEFVO15553 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MEFVO15553 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
MEFVO15553 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
MEFVO15553 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MEFVO15553 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MEFVO15553 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MEFVO15553 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MEFVO15553 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MEFVO15553 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MEFVO15553 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
MEFVO15553 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
MEFVO15553 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MEFVO15553 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MEFVO15553 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
MEFVO15553 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MEFVO15553 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MEFVO15553 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MEFVO15553 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MEFVO15553 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
MEFVO15553 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
MEFVO15553 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MEFVO15553 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MEFVO15553 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms