Protein–RNA interactions for Protein: O15550

KDM6A, Lysine-specific demethylase 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6AO15550 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
KDM6AO15550 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
KDM6AO15550 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
KDM6AO15550 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
KDM6AO15550 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
KDM6AO15550 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
KDM6AO15550 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
KDM6AO15550 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
KDM6AO15550 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
KDM6AO15550 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
KDM6AO15550 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
KDM6AO15550 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
KDM6AO15550 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
KDM6AO15550 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
KDM6AO15550 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
KDM6AO15550 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
KDM6AO15550 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
KDM6AO15550 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
KDM6AO15550 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
KDM6AO15550 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
KDM6AO15550 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
KDM6AO15550 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
KDM6AO15550 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
KDM6AO15550 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
KDM6AO15550 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
KDM6AO15550 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
KDM6AO15550 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
KDM6AO15550 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
KDM6AO15550 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
KDM6AO15550 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
KDM6AO15550 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
KDM6AO15550 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
KDM6AO15550 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
KDM6AO15550 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
KDM6AO15550 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
KDM6AO15550 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
KDM6AO15550 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
KDM6AO15550 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
KDM6AO15550 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
KDM6AO15550 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
KDM6AO15550 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
KDM6AO15550 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
KDM6AO15550 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
KDM6AO15550 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
KDM6AO15550 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
KDM6AO15550 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
KDM6AO15550 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
KDM6AO15550 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
KDM6AO15550 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
KDM6AO15550 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
KDM6AO15550 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
KDM6AO15550 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
KDM6AO15550 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
KDM6AO15550 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
KDM6AO15550 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
KDM6AO15550 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
KDM6AO15550 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
KDM6AO15550 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
KDM6AO15550 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
KDM6AO15550 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
KDM6AO15550 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
KDM6AO15550 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
KDM6AO15550 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
KDM6AO15550 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
KDM6AO15550 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
KDM6AO15550 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
KDM6AO15550 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC33.94■■■■□ 3.02
KDM6AO15550 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC33.94■■■■□ 3.02
KDM6AO15550 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
KDM6AO15550 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
KDM6AO15550 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
KDM6AO15550 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
KDM6AO15550 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
KDM6AO15550 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
KDM6AO15550 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
KDM6AO15550 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
KDM6AO15550 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
KDM6AO15550 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
KDM6AO15550 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
KDM6AO15550 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
KDM6AO15550 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
KDM6AO15550 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
KDM6AO15550 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC33.86■■■■□ 3.01
KDM6AO15550 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
KDM6AO15550 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC33.86■■■■□ 3.01
KDM6AO15550 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
KDM6AO15550 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
KDM6AO15550 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
KDM6AO15550 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
KDM6AO15550 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
KDM6AO15550 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
KDM6AO15550 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
KDM6AO15550 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
KDM6AO15550 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
KDM6AO15550 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
KDM6AO15550 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3.01
KDM6AO15550 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
KDM6AO15550 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
KDM6AO15550 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
KDM6AO15550 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms