Protein–RNA interactions for Protein: O15254

ACOX3, Peroxisomal acyl-coenzyme A oxidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACOX3O15254 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACOX3O15254 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACOX3O15254 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACOX3O15254 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACOX3O15254 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACOX3O15254 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACOX3O15254 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACOX3O15254 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ACOX3O15254 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ACOX3O15254 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ACOX3O15254 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACOX3O15254 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACOX3O15254 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACOX3O15254 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACOX3O15254 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACOX3O15254 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACOX3O15254 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACOX3O15254 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACOX3O15254 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACOX3O15254 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACOX3O15254 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ACOX3O15254 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ACOX3O15254 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACOX3O15254 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACOX3O15254 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACOX3O15254 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ACOX3O15254 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACOX3O15254 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACOX3O15254 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACOX3O15254 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACOX3O15254 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACOX3O15254 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACOX3O15254 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ACOX3O15254 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ACOX3O15254 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ACOX3O15254 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACOX3O15254 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACOX3O15254 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACOX3O15254 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACOX3O15254 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACOX3O15254 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACOX3O15254 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACOX3O15254 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACOX3O15254 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACOX3O15254 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACOX3O15254 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACOX3O15254 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACOX3O15254 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACOX3O15254 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACOX3O15254 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACOX3O15254 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACOX3O15254 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACOX3O15254 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACOX3O15254 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACOX3O15254 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACOX3O15254 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ACOX3O15254 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ACOX3O15254 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACOX3O15254 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACOX3O15254 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACOX3O15254 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ACOX3O15254 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACOX3O15254 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACOX3O15254 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACOX3O15254 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ACOX3O15254 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ACOX3O15254 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ACOX3O15254 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ACOX3O15254 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ACOX3O15254 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACOX3O15254 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACOX3O15254 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACOX3O15254 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACOX3O15254 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACOX3O15254 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACOX3O15254 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACOX3O15254 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACOX3O15254 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACOX3O15254 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ACOX3O15254 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ACOX3O15254 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ACOX3O15254 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACOX3O15254 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACOX3O15254 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ACOX3O15254 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACOX3O15254 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACOX3O15254 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACOX3O15254 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACOX3O15254 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACOX3O15254 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACOX3O15254 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACOX3O15254 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACOX3O15254 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACOX3O15254 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACOX3O15254 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACOX3O15254 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACOX3O15254 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACOX3O15254 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACOX3O15254 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACOX3O15254 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms