Protein–RNA interactions for Protein: O15060

ZBTB39, Zinc finger and BTB domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBTB39O15060 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZBTB39O15060 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZBTB39O15060 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZBTB39O15060 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZBTB39O15060 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZBTB39O15060 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZBTB39O15060 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZBTB39O15060 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZBTB39O15060 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZBTB39O15060 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZBTB39O15060 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZBTB39O15060 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZBTB39O15060 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZBTB39O15060 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZBTB39O15060 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZBTB39O15060 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZBTB39O15060 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ZBTB39O15060 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ZBTB39O15060 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ZBTB39O15060 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ZBTB39O15060 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
ZBTB39O15060 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ZBTB39O15060 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
ZBTB39O15060 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ZBTB39O15060 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
ZBTB39O15060 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZBTB39O15060 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZBTB39O15060 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ZBTB39O15060 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ZBTB39O15060 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ZBTB39O15060 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ZBTB39O15060 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ZBTB39O15060 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ZBTB39O15060 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ZBTB39O15060 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ZBTB39O15060 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ZBTB39O15060 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ZBTB39O15060 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ZBTB39O15060 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ZBTB39O15060 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ZBTB39O15060 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ZBTB39O15060 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZBTB39O15060 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZBTB39O15060 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZBTB39O15060 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZBTB39O15060 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZBTB39O15060 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZBTB39O15060 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZBTB39O15060 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZBTB39O15060 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZBTB39O15060 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZBTB39O15060 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZBTB39O15060 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZBTB39O15060 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
ZBTB39O15060 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZBTB39O15060 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
ZBTB39O15060 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZBTB39O15060 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZBTB39O15060 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ZBTB39O15060 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZBTB39O15060 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZBTB39O15060 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZBTB39O15060 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZBTB39O15060 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZBTB39O15060 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZBTB39O15060 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZBTB39O15060 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZBTB39O15060 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
ZBTB39O15060 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
ZBTB39O15060 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ZBTB39O15060 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
ZBTB39O15060 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZBTB39O15060 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZBTB39O15060 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZBTB39O15060 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZBTB39O15060 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
ZBTB39O15060 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZBTB39O15060 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZBTB39O15060 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZBTB39O15060 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZBTB39O15060 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZBTB39O15060 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZBTB39O15060 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZBTB39O15060 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
ZBTB39O15060 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
ZBTB39O15060 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
ZBTB39O15060 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZBTB39O15060 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZBTB39O15060 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZBTB39O15060 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ZBTB39O15060 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ZBTB39O15060 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ZBTB39O15060 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZBTB39O15060 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
ZBTB39O15060 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZBTB39O15060 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZBTB39O15060 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZBTB39O15060 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZBTB39O15060 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZBTB39O15060 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms