Protein–RNA interactions for Protein: O14920

IKBKB, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBKBO14920 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
IKBKBO14920 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
IKBKBO14920 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
IKBKBO14920 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
IKBKBO14920 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
IKBKBO14920 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
IKBKBO14920 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
IKBKBO14920 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
IKBKBO14920 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
IKBKBO14920 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
IKBKBO14920 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
IKBKBO14920 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
IKBKBO14920 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
IKBKBO14920 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
IKBKBO14920 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
IKBKBO14920 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
IKBKBO14920 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
IKBKBO14920 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
IKBKBO14920 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
IKBKBO14920 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
IKBKBO14920 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
IKBKBO14920 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
IKBKBO14920 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
IKBKBO14920 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
IKBKBO14920 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
IKBKBO14920 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
IKBKBO14920 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
IKBKBO14920 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
IKBKBO14920 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
IKBKBO14920 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
IKBKBO14920 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
IKBKBO14920 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
IKBKBO14920 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
IKBKBO14920 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
IKBKBO14920 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
IKBKBO14920 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
IKBKBO14920 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
IKBKBO14920 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
IKBKBO14920 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
IKBKBO14920 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
IKBKBO14920 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
IKBKBO14920 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
IKBKBO14920 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
IKBKBO14920 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
IKBKBO14920 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
IKBKBO14920 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
IKBKBO14920 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
IKBKBO14920 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
IKBKBO14920 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
IKBKBO14920 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
IKBKBO14920 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
IKBKBO14920 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
IKBKBO14920 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
IKBKBO14920 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
IKBKBO14920 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
IKBKBO14920 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
IKBKBO14920 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
IKBKBO14920 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
IKBKBO14920 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
IKBKBO14920 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
IKBKBO14920 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
IKBKBO14920 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
IKBKBO14920 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
IKBKBO14920 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
IKBKBO14920 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
IKBKBO14920 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
IKBKBO14920 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
IKBKBO14920 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
IKBKBO14920 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
IKBKBO14920 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
IKBKBO14920 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
IKBKBO14920 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
IKBKBO14920 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
IKBKBO14920 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
IKBKBO14920 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
IKBKBO14920 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
IKBKBO14920 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
IKBKBO14920 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
IKBKBO14920 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
IKBKBO14920 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
IKBKBO14920 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
IKBKBO14920 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
IKBKBO14920 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
IKBKBO14920 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
IKBKBO14920 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
IKBKBO14920 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
IKBKBO14920 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
IKBKBO14920 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
IKBKBO14920 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
IKBKBO14920 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
IKBKBO14920 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
IKBKBO14920 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
IKBKBO14920 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
IKBKBO14920 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
IKBKBO14920 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
IKBKBO14920 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
IKBKBO14920 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
IKBKBO14920 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
IKBKBO14920 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
IKBKBO14920 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms