Protein–RNA interactions for Protein: O14910

LIN7A, Protein lin-7 homolog A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN7AO14910 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LIN7AO14910 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LIN7AO14910 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LIN7AO14910 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
LIN7AO14910 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LIN7AO14910 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LIN7AO14910 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
LIN7AO14910 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LIN7AO14910 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
LIN7AO14910 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LIN7AO14910 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LIN7AO14910 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LIN7AO14910 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LIN7AO14910 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LIN7AO14910 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LIN7AO14910 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LIN7AO14910 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LIN7AO14910 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LIN7AO14910 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LIN7AO14910 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LIN7AO14910 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LIN7AO14910 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LIN7AO14910 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LIN7AO14910 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LIN7AO14910 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LIN7AO14910 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LIN7AO14910 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LIN7AO14910 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LIN7AO14910 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
LIN7AO14910 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LIN7AO14910 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
LIN7AO14910 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LIN7AO14910 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
LIN7AO14910 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LIN7AO14910 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LIN7AO14910 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LIN7AO14910 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LIN7AO14910 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LIN7AO14910 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
LIN7AO14910 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LIN7AO14910 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LIN7AO14910 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LIN7AO14910 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LIN7AO14910 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LIN7AO14910 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LIN7AO14910 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LIN7AO14910 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LIN7AO14910 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LIN7AO14910 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LIN7AO14910 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LIN7AO14910 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LIN7AO14910 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LIN7AO14910 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LIN7AO14910 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
LIN7AO14910 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LIN7AO14910 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LIN7AO14910 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LIN7AO14910 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LIN7AO14910 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LIN7AO14910 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LIN7AO14910 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
LIN7AO14910 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LIN7AO14910 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LIN7AO14910 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LIN7AO14910 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LIN7AO14910 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LIN7AO14910 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LIN7AO14910 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LIN7AO14910 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LIN7AO14910 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LIN7AO14910 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LIN7AO14910 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LIN7AO14910 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LIN7AO14910 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
LIN7AO14910 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LIN7AO14910 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LIN7AO14910 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LIN7AO14910 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LIN7AO14910 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LIN7AO14910 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LIN7AO14910 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LIN7AO14910 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LIN7AO14910 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LIN7AO14910 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
LIN7AO14910 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LIN7AO14910 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LIN7AO14910 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LIN7AO14910 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LIN7AO14910 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LIN7AO14910 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LIN7AO14910 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LIN7AO14910 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LIN7AO14910 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LIN7AO14910 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LIN7AO14910 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LIN7AO14910 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LIN7AO14910 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LIN7AO14910 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LIN7AO14910 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LIN7AO14910 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms