Protein–RNA interactions for Protein: O14649

KCNK3, Potassium channel subfamily K member 3, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK3O14649 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KCNK3O14649 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KCNK3O14649 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KCNK3O14649 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KCNK3O14649 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KCNK3O14649 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KCNK3O14649 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KCNK3O14649 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KCNK3O14649 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KCNK3O14649 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KCNK3O14649 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KCNK3O14649 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KCNK3O14649 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
KCNK3O14649 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KCNK3O14649 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KCNK3O14649 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KCNK3O14649 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KCNK3O14649 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KCNK3O14649 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KCNK3O14649 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
KCNK3O14649 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KCNK3O14649 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KCNK3O14649 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KCNK3O14649 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KCNK3O14649 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KCNK3O14649 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KCNK3O14649 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KCNK3O14649 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KCNK3O14649 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KCNK3O14649 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KCNK3O14649 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KCNK3O14649 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KCNK3O14649 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KCNK3O14649 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KCNK3O14649 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
KCNK3O14649 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KCNK3O14649 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KCNK3O14649 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KCNK3O14649 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KCNK3O14649 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KCNK3O14649 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KCNK3O14649 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KCNK3O14649 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KCNK3O14649 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KCNK3O14649 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
KCNK3O14649 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KCNK3O14649 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KCNK3O14649 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KCNK3O14649 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KCNK3O14649 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KCNK3O14649 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KCNK3O14649 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KCNK3O14649 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KCNK3O14649 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KCNK3O14649 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KCNK3O14649 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
KCNK3O14649 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KCNK3O14649 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KCNK3O14649 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KCNK3O14649 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KCNK3O14649 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KCNK3O14649 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KCNK3O14649 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KCNK3O14649 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KCNK3O14649 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
KCNK3O14649 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KCNK3O14649 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KCNK3O14649 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KCNK3O14649 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KCNK3O14649 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KCNK3O14649 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KCNK3O14649 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KCNK3O14649 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KCNK3O14649 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KCNK3O14649 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KCNK3O14649 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KCNK3O14649 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
KCNK3O14649 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
KCNK3O14649 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KCNK3O14649 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KCNK3O14649 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
KCNK3O14649 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KCNK3O14649 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KCNK3O14649 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KCNK3O14649 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KCNK3O14649 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KCNK3O14649 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KCNK3O14649 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KCNK3O14649 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KCNK3O14649 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KCNK3O14649 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KCNK3O14649 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KCNK3O14649 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KCNK3O14649 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KCNK3O14649 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KCNK3O14649 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KCNK3O14649 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
KCNK3O14649 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KCNK3O14649 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KCNK3O14649 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms