Protein–RNA interactions for Protein: O14646

CHD1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD1O14646 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC43.66■■■■■ 4.58
CHD1O14646 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC43.64■■■■■ 4.58
CHD1O14646 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.64■■■■■ 4.58
CHD1O14646 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC43.64■■■■■ 4.58
CHD1O14646 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC43.64■■■■■ 4.58
CHD1O14646 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC43.64■■■■■ 4.58
CHD1O14646 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC43.63■■■■■ 4.58
CHD1O14646 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC43.63■■■■■ 4.57
CHD1O14646 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.63■■■■■ 4.57
CHD1O14646 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.62■■■■■ 4.57
CHD1O14646 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC43.62■■■■■ 4.57
CHD1O14646 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC43.61■■■■■ 4.57
CHD1O14646 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC43.6■■■■■ 4.57
CHD1O14646 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC43.59■■■■■ 4.57
CHD1O14646 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.59■■■■■ 4.57
CHD1O14646 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC43.59■■■■■ 4.57
CHD1O14646 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.58■■■■■ 4.57
CHD1O14646 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.56■■■■■ 4.56
CHD1O14646 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.55■■■■■ 4.56
CHD1O14646 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC43.55■■■■■ 4.56
CHD1O14646 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC43.54■■■■■ 4.56
CHD1O14646 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC43.54■■■■■ 4.56
CHD1O14646 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.54■■■■■ 4.56
CHD1O14646 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.54■■■■■ 4.56
CHD1O14646 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.53■■■■■ 4.56
CHD1O14646 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC43.52■■■■■ 4.56
CHD1O14646 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC43.51■■■■■ 4.56
CHD1O14646 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC43.51■■■■■ 4.56
CHD1O14646 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC43.51■■■■■ 4.56
CHD1O14646 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.47■■■■■ 4.55
CHD1O14646 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC43.47■■■■■ 4.55
CHD1O14646 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
CHD1O14646 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC43.46■■■■■ 4.55
CHD1O14646 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC43.45■■■■■ 4.55
CHD1O14646 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC43.45■■■■■ 4.55
CHD1O14646 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.54
CHD1O14646 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC43.44■■■■■ 4.54
CHD1O14646 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
CHD1O14646 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC43.42■■■■■ 4.54
CHD1O14646 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.42■■■■■ 4.54
CHD1O14646 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC43.42■■■■■ 4.54
CHD1O14646 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC43.42■■■■■ 4.54
CHD1O14646 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC43.42■■■■■ 4.54
CHD1O14646 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
CHD1O14646 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC43.39■■■■■ 4.54
CHD1O14646 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC43.37■■■■■ 4.53
CHD1O14646 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
CHD1O14646 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC43.36■■■■■ 4.53
CHD1O14646 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
CHD1O14646 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC43.36■■■■■ 4.53
CHD1O14646 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC43.36■■■■■ 4.53
CHD1O14646 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC43.35■■■■■ 4.53
CHD1O14646 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC43.35■■■■■ 4.53
CHD1O14646 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC43.34■■■■■ 4.53
CHD1O14646 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC43.32■■■■■ 4.53
CHD1O14646 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC43.31■■■■■ 4.52
CHD1O14646 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC43.31■■■■■ 4.52
CHD1O14646 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC43.31■■■■■ 4.52
CHD1O14646 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC43.31■■■■■ 4.52
CHD1O14646 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
CHD1O14646 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC43.29■■■■■ 4.52
CHD1O14646 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.29■■■■■ 4.52
CHD1O14646 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC43.28■■■■■ 4.52
CHD1O14646 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC43.27■■■■■ 4.52
CHD1O14646 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
CHD1O14646 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC43.23■■■■■ 4.51
CHD1O14646 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.23■■■■■ 4.51
CHD1O14646 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.2■■■■■ 4.51
CHD1O14646 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC43.2■■■■■ 4.51
CHD1O14646 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC43.2■■■■■ 4.51
CHD1O14646 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.51
CHD1O14646 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.51
CHD1O14646 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC43.19■■■■■ 4.51
CHD1O14646 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.5
CHD1O14646 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.5
CHD1O14646 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC43.18■■■■■ 4.5
CHD1O14646 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC43.18■■■■■ 4.5
CHD1O14646 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
CHD1O14646 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.17■■■■■ 4.5
CHD1O14646 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
CHD1O14646 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC43.17■■■■■ 4.5
CHD1O14646 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
CHD1O14646 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC43.16■■■■■ 4.5
CHD1O14646 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC43.16■■■■■ 4.5
CHD1O14646 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
CHD1O14646 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
CHD1O14646 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC43.14■■■■■ 4.5
CHD1O14646 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC43.14■■■■■ 4.5
CHD1O14646 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
CHD1O14646 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.13■■■■■ 4.49
CHD1O14646 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC43.12■■■■■ 4.49
CHD1O14646 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC43.12■■■■■ 4.49
CHD1O14646 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
CHD1O14646 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC43.1■■■■■ 4.49
CHD1O14646 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
CHD1O14646 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC43.08■■■■■ 4.49
CHD1O14646 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC43.08■■■■■ 4.49
CHD1O14646 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC43.08■■■■■ 4.49
CHD1O14646 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC43.08■■■■■ 4.49
CHD1O14646 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms