Protein–RNA interactions for Protein: O14523

C2CD2L, Phospholipid transfer protein C2CD2L, humanhuman

Predictions only

Length 706 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2CD2LO14523 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
C2CD2LO14523 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
C2CD2LO14523 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
C2CD2LO14523 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
C2CD2LO14523 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
C2CD2LO14523 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
C2CD2LO14523 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
C2CD2LO14523 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
C2CD2LO14523 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
C2CD2LO14523 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
C2CD2LO14523 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
C2CD2LO14523 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
C2CD2LO14523 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
C2CD2LO14523 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
C2CD2LO14523 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
C2CD2LO14523 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
C2CD2LO14523 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
C2CD2LO14523 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
C2CD2LO14523 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
C2CD2LO14523 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
C2CD2LO14523 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
C2CD2LO14523 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
C2CD2LO14523 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
C2CD2LO14523 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
C2CD2LO14523 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
C2CD2LO14523 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
C2CD2LO14523 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
C2CD2LO14523 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
C2CD2LO14523 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
C2CD2LO14523 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
C2CD2LO14523 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
C2CD2LO14523 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
C2CD2LO14523 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
C2CD2LO14523 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
C2CD2LO14523 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
C2CD2LO14523 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
C2CD2LO14523 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
C2CD2LO14523 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
C2CD2LO14523 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
C2CD2LO14523 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
C2CD2LO14523 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
C2CD2LO14523 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
C2CD2LO14523 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
C2CD2LO14523 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
C2CD2LO14523 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
C2CD2LO14523 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
C2CD2LO14523 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
C2CD2LO14523 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
C2CD2LO14523 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
C2CD2LO14523 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
C2CD2LO14523 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
C2CD2LO14523 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
C2CD2LO14523 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
C2CD2LO14523 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
C2CD2LO14523 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
C2CD2LO14523 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
C2CD2LO14523 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
C2CD2LO14523 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
C2CD2LO14523 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
C2CD2LO14523 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
C2CD2LO14523 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
C2CD2LO14523 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
C2CD2LO14523 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
C2CD2LO14523 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
C2CD2LO14523 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
C2CD2LO14523 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
C2CD2LO14523 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
C2CD2LO14523 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
C2CD2LO14523 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
C2CD2LO14523 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
C2CD2LO14523 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
C2CD2LO14523 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
C2CD2LO14523 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
C2CD2LO14523 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
C2CD2LO14523 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
C2CD2LO14523 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
C2CD2LO14523 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
C2CD2LO14523 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
C2CD2LO14523 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
C2CD2LO14523 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
C2CD2LO14523 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
C2CD2LO14523 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
C2CD2LO14523 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
C2CD2LO14523 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
C2CD2LO14523 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
C2CD2LO14523 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
C2CD2LO14523 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
C2CD2LO14523 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
C2CD2LO14523 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
C2CD2LO14523 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
C2CD2LO14523 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
C2CD2LO14523 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
C2CD2LO14523 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
C2CD2LO14523 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
C2CD2LO14523 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
C2CD2LO14523 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
C2CD2LO14523 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
C2CD2LO14523 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
C2CD2LO14523 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
C2CD2LO14523 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms