Protein–RNA interactions for Protein: O14497

ARID1A, AT-rich interactive domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 2,285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID1AO14497 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARID1AO14497 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARID1AO14497 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARID1AO14497 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARID1AO14497 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARID1AO14497 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARID1AO14497 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARID1AO14497 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARID1AO14497 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARID1AO14497 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARID1AO14497 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARID1AO14497 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARID1AO14497 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARID1AO14497 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARID1AO14497 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARID1AO14497 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARID1AO14497 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARID1AO14497 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARID1AO14497 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARID1AO14497 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARID1AO14497 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARID1AO14497 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARID1AO14497 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARID1AO14497 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARID1AO14497 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARID1AO14497 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARID1AO14497 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ARID1AO14497 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ARID1AO14497 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ARID1AO14497 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ARID1AO14497 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ARID1AO14497 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ARID1AO14497 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ARID1AO14497 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ARID1AO14497 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ARID1AO14497 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARID1AO14497 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARID1AO14497 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARID1AO14497 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARID1AO14497 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARID1AO14497 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARID1AO14497 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARID1AO14497 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARID1AO14497 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARID1AO14497 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARID1AO14497 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARID1AO14497 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARID1AO14497 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARID1AO14497 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ARID1AO14497 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARID1AO14497 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARID1AO14497 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARID1AO14497 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARID1AO14497 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARID1AO14497 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARID1AO14497 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARID1AO14497 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARID1AO14497 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARID1AO14497 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARID1AO14497 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARID1AO14497 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARID1AO14497 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARID1AO14497 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARID1AO14497 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARID1AO14497 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARID1AO14497 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARID1AO14497 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARID1AO14497 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID1AO14497 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARID1AO14497 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARID1AO14497 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARID1AO14497 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARID1AO14497 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARID1AO14497 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARID1AO14497 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARID1AO14497 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARID1AO14497 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARID1AO14497 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARID1AO14497 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARID1AO14497 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARID1AO14497 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARID1AO14497 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARID1AO14497 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID1AO14497 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID1AO14497 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID1AO14497 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID1AO14497 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID1AO14497 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID1AO14497 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARID1AO14497 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARID1AO14497 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID1AO14497 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID1AO14497 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID1AO14497 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID1AO14497 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARID1AO14497 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARID1AO14497 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARID1AO14497 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARID1AO14497 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARID1AO14497 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms