Protein–RNA interactions for Protein: O08999

Ltbp2, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltbp2O08999 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ltbp2O08999 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ltbp2O08999 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ltbp2O08999 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ltbp2O08999 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ltbp2O08999 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ltbp2O08999 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Ltbp2O08999 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ltbp2O08999 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Ltbp2O08999 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ltbp2O08999 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ltbp2O08999 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ltbp2O08999 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Ltbp2O08999 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ltbp2O08999 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ltbp2O08999 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ltbp2O08999 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ltbp2O08999 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Ltbp2O08999 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ltbp2O08999 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ltbp2O08999 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ltbp2O08999 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ltbp2O08999 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ltbp2O08999 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ltbp2O08999 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ltbp2O08999 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ltbp2O08999 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ltbp2O08999 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ltbp2O08999 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ltbp2O08999 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Ltbp2O08999 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ltbp2O08999 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ltbp2O08999 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ltbp2O08999 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ltbp2O08999 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ltbp2O08999 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ltbp2O08999 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ltbp2O08999 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ltbp2O08999 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ltbp2O08999 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ltbp2O08999 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ltbp2O08999 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ltbp2O08999 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ltbp2O08999 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ltbp2O08999 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ltbp2O08999 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ltbp2O08999 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ltbp2O08999 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ltbp2O08999 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ltbp2O08999 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ltbp2O08999 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ltbp2O08999 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ltbp2O08999 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ltbp2O08999 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ltbp2O08999 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ltbp2O08999 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ltbp2O08999 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ltbp2O08999 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ltbp2O08999 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ltbp2O08999 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ltbp2O08999 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ltbp2O08999 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Ltbp2O08999 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Ltbp2O08999 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ltbp2O08999 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ltbp2O08999 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Ltbp2O08999 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ltbp2O08999 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ltbp2O08999 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ltbp2O08999 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ltbp2O08999 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ltbp2O08999 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ltbp2O08999 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ltbp2O08999 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ltbp2O08999 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ltbp2O08999 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ltbp2O08999 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ltbp2O08999 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ltbp2O08999 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ltbp2O08999 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ltbp2O08999 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ltbp2O08999 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ltbp2O08999 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ltbp2O08999 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ltbp2O08999 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ltbp2O08999 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ltbp2O08999 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ltbp2O08999 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ltbp2O08999 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ltbp2O08999 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ltbp2O08999 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ltbp2O08999 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ltbp2O08999 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ltbp2O08999 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ltbp2O08999 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ltbp2O08999 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ltbp2O08999 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ltbp2O08999 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ltbp2O08999 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ltbp2O08999 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms