Protein–RNA interactions for Protein: O08983

Hps1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

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Length 704 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1O08983 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hps1O08983 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hps1O08983 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hps1O08983 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hps1O08983 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hps1O08983 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hps1O08983 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hps1O08983 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Hps1O08983 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hps1O08983 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hps1O08983 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hps1O08983 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hps1O08983 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hps1O08983 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Hps1O08983 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hps1O08983 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hps1O08983 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hps1O08983 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hps1O08983 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hps1O08983 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hps1O08983 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hps1O08983 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hps1O08983 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hps1O08983 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hps1O08983 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hps1O08983 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hps1O08983 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Hps1O08983 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hps1O08983 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hps1O08983 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hps1O08983 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Hps1O08983 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hps1O08983 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hps1O08983 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hps1O08983 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hps1O08983 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hps1O08983 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hps1O08983 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hps1O08983 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hps1O08983 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hps1O08983 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hps1O08983 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hps1O08983 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hps1O08983 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hps1O08983 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hps1O08983 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Hps1O08983 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hps1O08983 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hps1O08983 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Hps1O08983 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hps1O08983 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Hps1O08983 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hps1O08983 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hps1O08983 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hps1O08983 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hps1O08983 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hps1O08983 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Hps1O08983 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hps1O08983 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hps1O08983 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hps1O08983 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hps1O08983 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hps1O08983 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hps1O08983 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hps1O08983 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hps1O08983 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hps1O08983 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hps1O08983 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hps1O08983 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hps1O08983 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hps1O08983 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hps1O08983 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hps1O08983 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hps1O08983 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hps1O08983 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hps1O08983 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hps1O08983 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hps1O08983 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hps1O08983 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hps1O08983 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Hps1O08983 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Hps1O08983 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hps1O08983 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hps1O08983 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hps1O08983 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hps1O08983 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hps1O08983 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hps1O08983 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hps1O08983 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hps1O08983 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hps1O08983 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hps1O08983 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hps1O08983 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hps1O08983 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hps1O08983 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hps1O08983 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hps1O08983 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hps1O08983 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hps1O08983 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hps1O08983 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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