Protein–RNA interactions for Protein: O08976

Pbsn, Probasin, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PbsnO08976 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PbsnO08976 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PbsnO08976 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PbsnO08976 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PbsnO08976 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PbsnO08976 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PbsnO08976 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PbsnO08976 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PbsnO08976 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PbsnO08976 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PbsnO08976 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PbsnO08976 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PbsnO08976 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PbsnO08976 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PbsnO08976 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PbsnO08976 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PbsnO08976 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PbsnO08976 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PbsnO08976 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PbsnO08976 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PbsnO08976 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PbsnO08976 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PbsnO08976 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PbsnO08976 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PbsnO08976 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PbsnO08976 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PbsnO08976 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PbsnO08976 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PbsnO08976 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PbsnO08976 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PbsnO08976 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PbsnO08976 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PbsnO08976 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PbsnO08976 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PbsnO08976 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PbsnO08976 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PbsnO08976 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PbsnO08976 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PbsnO08976 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PbsnO08976 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PbsnO08976 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PbsnO08976 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PbsnO08976 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PbsnO08976 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PbsnO08976 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PbsnO08976 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PbsnO08976 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PbsnO08976 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PbsnO08976 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PbsnO08976 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PbsnO08976 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PbsnO08976 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PbsnO08976 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PbsnO08976 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PbsnO08976 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PbsnO08976 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PbsnO08976 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PbsnO08976 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PbsnO08976 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PbsnO08976 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PbsnO08976 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PbsnO08976 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PbsnO08976 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PbsnO08976 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PbsnO08976 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PbsnO08976 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PbsnO08976 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PbsnO08976 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PbsnO08976 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PbsnO08976 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PbsnO08976 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PbsnO08976 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PbsnO08976 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PbsnO08976 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PbsnO08976 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PbsnO08976 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PbsnO08976 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PbsnO08976 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PbsnO08976 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PbsnO08976 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PbsnO08976 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PbsnO08976 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PbsnO08976 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PbsnO08976 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PbsnO08976 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PbsnO08976 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PbsnO08976 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PbsnO08976 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PbsnO08976 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PbsnO08976 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PbsnO08976 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PbsnO08976 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PbsnO08976 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PbsnO08976 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PbsnO08976 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PbsnO08976 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PbsnO08976 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PbsnO08976 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PbsnO08976 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PbsnO08976 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms