Protein–RNA interactions for Protein: O08792

Ebf2, Transcription factor COE2, mousemouse

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf2O08792 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ebf2O08792 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ebf2O08792 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ebf2O08792 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ebf2O08792 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ebf2O08792 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ebf2O08792 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ebf2O08792 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ebf2O08792 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ebf2O08792 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ebf2O08792 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ebf2O08792 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ebf2O08792 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ebf2O08792 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ebf2O08792 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ebf2O08792 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ebf2O08792 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ebf2O08792 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ebf2O08792 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ebf2O08792 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ebf2O08792 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ebf2O08792 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ebf2O08792 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ebf2O08792 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ebf2O08792 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ebf2O08792 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ebf2O08792 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ebf2O08792 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ebf2O08792 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ebf2O08792 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ebf2O08792 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ebf2O08792 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ebf2O08792 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ebf2O08792 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ebf2O08792 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ebf2O08792 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ebf2O08792 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ebf2O08792 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ebf2O08792 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ebf2O08792 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ebf2O08792 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ebf2O08792 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ebf2O08792 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ebf2O08792 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ebf2O08792 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ebf2O08792 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ebf2O08792 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ebf2O08792 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ebf2O08792 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ebf2O08792 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ebf2O08792 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ebf2O08792 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ebf2O08792 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ebf2O08792 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ebf2O08792 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ebf2O08792 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ebf2O08792 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ebf2O08792 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ebf2O08792 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ebf2O08792 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ebf2O08792 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ebf2O08792 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ebf2O08792 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ebf2O08792 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ebf2O08792 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ebf2O08792 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ebf2O08792 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ebf2O08792 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ebf2O08792 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ebf2O08792 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ebf2O08792 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ebf2O08792 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ebf2O08792 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ebf2O08792 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ebf2O08792 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ebf2O08792 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ebf2O08792 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ebf2O08792 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ebf2O08792 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ebf2O08792 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ebf2O08792 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ebf2O08792 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ebf2O08792 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ebf2O08792 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ebf2O08792 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ebf2O08792 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ebf2O08792 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ebf2O08792 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ebf2O08792 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ebf2O08792 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ebf2O08792 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ebf2O08792 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ebf2O08792 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ebf2O08792 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ebf2O08792 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ebf2O08792 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ebf2O08792 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ebf2O08792 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ebf2O08792 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ebf2O08792 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.2 ms